81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3167 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
637 aa  1289    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  63.92 
 
 
1518 aa  263  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  67.2 
 
 
500 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60 
 
 
1687 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  50.4 
 
 
1625 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3169  S-layer domain-containing protein  61.58 
 
 
533 aa  240  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  65.41 
 
 
461 aa  236  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  60.96 
 
 
1129 aa  232  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  63.68 
 
 
568 aa  231  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  51.05 
 
 
657 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  47.15 
 
 
601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  43.98 
 
 
617 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  42.05 
 
 
793 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2527  protein of unknown function DUF1535  41.04 
 
 
904 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.776522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4057  hypothetical protein  40.21 
 
 
910 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0719  hypothetical protein  42.26 
 
 
818 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09170  hypothetical protein  35.85 
 
 
808 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.887975  normal  0.329696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  33.33 
 
 
1657 aa  84  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0373  hypothetical protein  36 
 
 
496 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154623  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 
878 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  40.48 
 
 
2117 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  28.98 
 
 
878 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  39.77 
 
 
1825 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  32.95 
 
 
878 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  35.98 
 
 
2024 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3335  hypothetical protein  33.87 
 
 
577 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304879  normal  0.237472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4059  hypothetical protein  34.81 
 
 
587 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  36.64 
 
 
715 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 
652 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  32.14 
 
 
1951 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2615  CHAP domain-containing protein  29.53 
 
 
560 aa  64.7  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  30.71 
 
 
604 aa  64.7  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4852  hypothetical protein  30.56 
 
 
316 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  32.35 
 
 
3834 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  27.71 
 
 
514 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.38 
 
 
995 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  26.7 
 
 
1131 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  26.7 
 
 
1131 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  28.8 
 
 
599 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  31.62 
 
 
333 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  26.59 
 
 
1174 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  39.81 
 
 
759 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  44.12 
 
 
2182 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.8 
 
 
1029 aa  53.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2873  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  32.28 
 
 
1554 aa  51.2  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0258698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  29.24 
 
 
551 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.57 
 
 
1607 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  26.19 
 
 
2178 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  24.08 
 
 
1821 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  34.34 
 
 
635 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  32.52 
 
 
578 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  26.98 
 
 
767 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  42.62 
 
 
1467 aa  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  30 
 
 
489 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  31.09 
 
 
484 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.35 
 
 
1328 aa  47.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4263  hypothetical protein  30.93 
 
 
848 aa  47.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  26.67 
 
 
404 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  29.91 
 
 
697 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6193  outer capsid protein Hoc  37.35 
 
 
228 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  34.95 
 
 
282 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  33.86 
 
 
758 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  26.24 
 
 
262 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.46 
 
 
640 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.06 
 
 
639 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  26.24 
 
 
262 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  26.53 
 
 
218 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  20.83 
 
 
1009 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.66 
 
 
940 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1179  S-layer domain protein  27.27 
 
 
218 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  22.09 
 
 
857 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  33.7 
 
 
690 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  32.32 
 
 
1128 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.18 
 
 
1226 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2076  hypothetical protein  36.59 
 
 
465 aa  44.3  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.960322  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  23.5 
 
 
717 aa  44.3  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.11 
 
 
1234 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  37.04 
 
 
1937 aa  43.9  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1546  hypothetical protein  22.17 
 
 
731 aa  43.9  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.37456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4160  S-layer domain protein  30.15 
 
 
218 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  28.15 
 
 
861 aa  43.9  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>