97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1989 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  732    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  80.31 
 
 		 391 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2468  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  29.45 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  26.55 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  25.45 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  25.32 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  29.39 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  28.36 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  27.27 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  27.13 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  26.86 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  26.86 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  26.86 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  28.41 
 
 		 487 aa  53.5  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4451  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 399 aa  49.7  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  23.24 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.24 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 503 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  26.37 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.17 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  26.29 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  26.29 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5800  major facilitator superfamily transporter  28.63 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  21.48 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  24.69 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  22.65 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.79 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  22.65 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  28.9 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  23.33 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  22.65 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  22.02 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  23.1 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  24.24 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  26.11 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  24.73 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  26.11 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  26.11 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2302  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  28.91 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  25.34 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 503 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>