87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2468 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2468  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 397 aa  738    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  31.74 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  29.67 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  30.29 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28350  arabinose efflux permease family protein  35.42 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  31.33 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  27.94 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.41 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  27.9 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5800  major facilitator superfamily transporter  29 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  21.81 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  31.13 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  31.13 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  31.13 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  30.42 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  31.13 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 437 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1316  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 447 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.96 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.93 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.64 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.32 
 
 		 506 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0909  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.0144612 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.96 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  27.71 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0903  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  36.36 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0920  major facilitator superfamily transporter  28.99 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  31.52 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  32.56 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  25.49 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  30.72 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  27.41 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  27.02 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  32.46 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.2 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  43.66 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  40 
 
 		 544 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  35.06 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  23.53 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  26.67 
 
 		 450 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17830  Major Facilitator Superfamily transporter  32.09 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  30.34 
 
 		 485 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4342  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 408 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>