144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0797 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0797  NLP/P60 protein  100 
 
 
254 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0914  NLP/P60 protein  71.65 
 
 
259 aa  299  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4425  hypothetical protein  43.49 
 
 
260 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2336  hypothetical protein  41.81 
 
 
254 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1785  cell wall-associated hydrolase  41.78 
 
 
214 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  38.17 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  32.95 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  31.09 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2065  Peptidoglycan-binding LysM  39.86 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  30.86 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  39.56 
 
 
350 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  29.8 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  30.99 
 
 
458 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  37.88 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  33.67 
 
 
208 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  28.31 
 
 
271 aa  52.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.22 
 
 
337 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  32.11 
 
 
331 aa  52  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  35.38 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  30.38 
 
 
337 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  28.06 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  28.23 
 
 
1048 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  24.84 
 
 
340 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  40 
 
 
343 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  32.35 
 
 
472 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  31.58 
 
 
325 aa  48.5  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0023  peptidase, M23/M37 family protein  34.25 
 
 
735 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.118642  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  30 
 
 
467 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  31.18 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  30 
 
 
467 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  31.18 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  32.46 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  23.31 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  34.04 
 
 
335 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0169  peptidase, M23/M37 family protein  34.25 
 
 
735 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000801238  hitchhiker  6.69812e-28 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0135  peptidase, M23/M37 family protein  34.25 
 
 
735 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0705841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  27.27 
 
 
476 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  35.21 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  29.69 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  41.3 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  27.78 
 
 
478 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.31 
 
 
372 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  30 
 
 
472 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  32.26 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  32.86 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  38.24 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  30.56 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  35.29 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  31.18 
 
 
257 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  31.18 
 
 
257 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  32.35 
 
 
239 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  35.29 
 
 
256 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  35.29 
 
 
256 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  31.18 
 
 
257 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  35.29 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.43 
 
 
531 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.11 
 
 
321 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  29.36 
 
 
453 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  29.63 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  31.43 
 
 
475 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  31.43 
 
 
475 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  30.11 
 
 
469 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  35.29 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  31.43 
 
 
475 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  27.78 
 
 
479 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.85 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  24.6 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  30.93 
 
 
333 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  28.57 
 
 
298 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  36.67 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  30.11 
 
 
469 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  30.11 
 
 
469 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  29.73 
 
 
159 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30.3 
 
 
341 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  30.11 
 
 
469 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  32.65 
 
 
188 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.43 
 
 
292 aa  45.8  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  29.21 
 
 
524 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  28.72 
 
 
417 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  32.72 
 
 
200 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  30.71 
 
 
175 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  51.43 
 
 
436 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  51.43 
 
 
436 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  29.67 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  47.22 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  29.67 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  23.6 
 
 
210 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  29.67 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  27.96 
 
 
467 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3253  NLP/P60 protein  31.52 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.821613  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  47.22 
 
 
193 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  32.63 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  51.43 
 
 
436 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  29.79 
 
 
459 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
859 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  32.56 
 
 
447 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  32.39 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>