285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0375 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30680  histidine ammonia-lyase  67.05 
 
 
518 aa  638    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.86432  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  71.35 
 
 
537 aa  724    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  65.64 
 
 
514 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  67.31 
 
 
514 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0589  histidine ammonia-lyase  92.08 
 
 
530 aa  973    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00954752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0375  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
530 aa  1057    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0254  histidine ammonia-lyase  68.43 
 
 
517 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  65.06 
 
 
534 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  64.81 
 
 
515 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04180  histidine ammonia-lyase  63.04 
 
 
544 aa  604  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0787941 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1584  histidine ammonia-lyase  62.6 
 
 
517 aa  600  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  64.24 
 
 
526 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4453  histidine ammonia-lyase  65.04 
 
 
514 aa  592  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365428  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4398  histidine ammonia-lyase  61.15 
 
 
533 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6266  histidine ammonia-lyase  66.73 
 
 
503 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  56.9 
 
 
512 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  56.9 
 
 
512 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1421  histidine ammonia-lyase  62.21 
 
 
514 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  56.63 
 
 
509 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  47.9 
 
 
513 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  45.68 
 
 
509 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  42.69 
 
 
516 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  48.52 
 
 
506 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  40.92 
 
 
507 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  45.9 
 
 
507 aa  393  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  43.3 
 
 
508 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  42.05 
 
 
533 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  47.44 
 
 
506 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  43.46 
 
 
511 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  45.27 
 
 
498 aa  372  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  44.49 
 
 
505 aa  373  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  45.02 
 
 
526 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  44.15 
 
 
520 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  45.08 
 
 
516 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  45.97 
 
 
499 aa  360  5e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  41.88 
 
 
508 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  41.39 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  42.15 
 
 
511 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  41.54 
 
 
536 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0711  histidine ammonia-lyase  44.73 
 
 
513 aa  353  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  41.81 
 
 
511 aa  349  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  47.59 
 
 
508 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  42.17 
 
 
511 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  42.94 
 
 
504 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5927  histidine ammonia-lyase  43.16 
 
 
511 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.14133 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  38.31 
 
 
523 aa  346  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  46.64 
 
 
508 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6923  histidine ammonia-lyase  42.52 
 
 
511 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19647  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  41.73 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  47.17 
 
 
508 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  43.37 
 
 
515 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  42.36 
 
 
511 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2646  histidine ammonia-lyase  41.51 
 
 
518 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0281382  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4104  histidine ammonia-lyase  42.03 
 
 
563 aa  342  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  41.73 
 
 
511 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2474  histidine ammonia-lyase  43.13 
 
 
518 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2880  histidine ammonia-lyase  40.57 
 
 
518 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  41.68 
 
 
497 aa  340  5e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  41.52 
 
 
505 aa  339  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  43.7 
 
 
524 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  41.67 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  45.3 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  41.54 
 
 
511 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  41.63 
 
 
519 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4629  histidine ammonia-lyase  40.04 
 
 
528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  41.84 
 
 
510 aa  336  5e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  42.2 
 
 
513 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  43.18 
 
 
513 aa  336  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  42.19 
 
 
513 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  41.85 
 
 
513 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  44.16 
 
 
510 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
505 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  44 
 
 
509 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1579  histidine ammonia-lyase  44.4 
 
 
507 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179802  normal  0.0722817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
506 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  41.8 
 
 
513 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  41.8 
 
 
513 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  41.8 
 
 
513 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  46.42 
 
 
508 aa  333  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
506 aa  333  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 
505 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 
505 aa  332  9e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  40.87 
 
 
505 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
506 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  40.87 
 
 
505 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
506 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 
505 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  40.91 
 
 
506 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 
513 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 
513 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  41.25 
 
 
513 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  39.73 
 
 
506 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 
505 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  41.3 
 
 
505 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5958  histidine ammonia-lyase  42.64 
 
 
512 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  41.09 
 
 
505 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  39.8 
 
 
511 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  41.98 
 
 
515 aa  330  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2935  histidine ammonia-lyase  43.97 
 
 
507 aa  329  8e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 
522 aa  329  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>