More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0915 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0915  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 413 aa  851    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 411 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 412 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 413 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 414 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 413 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 413 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 414 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  56.27 
 
 		 412 aa  494  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.74 
 
 		 418 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.46 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 414 aa  487  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 415 aa  480  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1350  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  58.42 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  56.44 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  57.36 
 
 		 415 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  55.67 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 419 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 		 423 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 411 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 422 aa  463  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  58.66 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 416 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  53.51 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  54.85 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  54.43 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  52.97 
 
 		 424 aa  455  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  53.9 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1274  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  52.4 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>