76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0568 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 304 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  38.1 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  24.35 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 113 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 195 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 143 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  40.68 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 		 191 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 68 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  37.74 
 
 		 105 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 86 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 116 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 194 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 75 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 191 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 179 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 184 aa  46.2  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 179 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  32.26 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  40 
 
 		 87 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1279  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 118 aa  45.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 108 aa  45.8  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 65 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 197 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  40 
 
 		 64 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 75 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 134 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 194 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 80 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 192 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  24.29 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 117 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 91 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2864  hypothetical protein  39.66 
 
 		 622 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000347302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 77 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 64 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  36.36 
 
 		 64 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  27.59 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0080  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0107251  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  25.64 
 
 		 190 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  21.01 
 
 		 187 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 76 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  25.4 
 
 		 223 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  29.31 
 
 		 149 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 109 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  24.14 
 
 		 806 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 63 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  29.31 
 
 		 149 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 72 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  29.31 
 
 		 149 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 		 490 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 195 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 91 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1554  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  38.18 
 
 		 62 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  24.29 
 
 		 207 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3922  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.88 
 
 		 118 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 387 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 224 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  25.4 
 
 		 215 aa  42.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>