More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0732 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0732  aminotransferase class V  100 
 
 		 382 aa  787    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0224667  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1347  aminotransferase class V  43.73 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145912  normal  0.878821 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  40.55 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09940  cysteine desulfurase family protein  39.69 
 
 		 392 aa  262  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.128931  hitchhiker  0.00000254642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  36.2 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  38.1 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.08 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  34.2 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  36.22 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  34.82 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  36.55 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 419 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  38.82 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  35.29 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  36.24 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  35.29 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  37.08 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  35.34 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  37.89 
 
 		 422 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  34.2 
 
 		 414 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  38.08 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  34.11 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  37.75 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  35.57 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  34.65 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  35.42 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  38.32 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  33.07 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  33.24 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  33.24 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  34.91 
 
 		 398 aa  215  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  37.96 
 
 		 391 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  36.53 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 392 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  33.6 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  34.2 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  39.79 
 
 		 388 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  33.08 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  37.34 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.37 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  35.04 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  36.67 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  36.78 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  34.82 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  36.34 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  35.06 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  35.62 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  35.26 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  36.84 
 
 		 398 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  36.6 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  36.5 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  35.58 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  34.29 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  38.71 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  38.38 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  33.42 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  36.46 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  32.55 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  36.36 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  35.69 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  33.88 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  34.04 
 
 		 386 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  34.38 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  34.97 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  36.88 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  34.33 
 
 		 381 aa  209  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 387 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  33.88 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  34.97 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  33.88 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  34.43 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  36.01 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  33.88 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  33.88 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  34 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  33.68 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  33.88 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  39.52 
 
 		 377 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03780  cysteine desulfurase family protein  38.23 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  37.37 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  33.86 
 
 		 388 aa  205  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  32.47 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2532  cysteine desulfurase  34.04 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  33.61 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.68 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  38.15 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  33.59 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  33.6 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  38.05 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  35.48 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  34.68 
 
 		 1143 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  36.2 
 
 		 398 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  35.42 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  33.07 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  36.36 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  33.76 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  34.57 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  34.04 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>