38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1835 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  100 
 
 
674 aa  1383    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  39.81 
 
 
523 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  43.9 
 
 
515 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.15 
 
 
549 aa  294  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  41.62 
 
 
425 aa  244  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  34.1 
 
 
559 aa  164  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  33.97 
 
 
382 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  31.59 
 
 
391 aa  150  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  33.24 
 
 
382 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  30.83 
 
 
978 aa  143  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  29.23 
 
 
694 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  31.99 
 
 
408 aa  128  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  31.58 
 
 
392 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  29.17 
 
 
1015 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.53 
 
 
397 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  29.97 
 
 
589 aa  124  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  29.89 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  28.85 
 
 
526 aa  121  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  28.84 
 
 
388 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  28.93 
 
 
949 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  30.97 
 
 
1173 aa  104  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  28.95 
 
 
421 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  28.72 
 
 
377 aa  93.2  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  28.49 
 
 
399 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  29.41 
 
 
816 aa  90.1  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  29.1 
 
 
391 aa  87  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  29.92 
 
 
543 aa  85.5  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  30.68 
 
 
419 aa  83.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0005  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.54 
 
 
857 aa  80.5  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  25.56 
 
 
509 aa  65.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1900  hypothetical protein  24.92 
 
 
384 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.42 
 
 
383 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  25 
 
 
367 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  28.46 
 
 
472 aa  61.2  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1211  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  30.58 
 
 
757 aa  56.6  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  25.71 
 
 
652 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  23.81 
 
 
823 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4186  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.73 
 
 
481 aa  44.3  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>