More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1732 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
630 aa  1310    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
736 aa  659    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 
637 aa  783    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  50.33 
 
 
662 aa  618  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 
657 aa  613  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
657 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
659 aa  611  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
641 aa  611  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
646 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
677 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
657 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
596 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
657 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
647 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
604 aa  589  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
604 aa  591  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
648 aa  590  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
645 aa  589  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
675 aa  588  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
649 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
647 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
653 aa  576  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
610 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
643 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 
644 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
644 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
652 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
644 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
635 aa  567  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
615 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
608 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
644 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
608 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
645 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
645 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
645 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
645 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
643 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
645 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
645 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
645 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2841  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
606 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
645 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
638 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
647 aa  561  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
645 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
643 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
645 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
645 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0760  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
607 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.281808  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0731  threonyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
607 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
645 aa  553  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
648 aa  554  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
648 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
635 aa  551  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
635 aa  551  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
644 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
659 aa  545  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
637 aa  542  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
583 aa  545  1e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
639 aa  545  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 
645 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
633 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
645 aa  538  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
635 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
644 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
634 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
646 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
635 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
582 aa  535  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
645 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  44.55 
 
 
582 aa  534  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 
634 aa  534  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
582 aa  530  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
631 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
648 aa  531  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
637 aa  530  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
636 aa  528  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
614 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
645 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
648 aa  525  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
636 aa  524  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
644 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
647 aa  524  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
636 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
636 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
639 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
643 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
643 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2511  threonyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
594 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0678043  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
644 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
638 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
644 aa  512  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
647 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
640 aa  511  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
595 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
647 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
595 aa  511  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
635 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 
644 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>