More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1684 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1684  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 668 aa  1386    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 620 aa  157  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 662 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 655 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 656 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 634 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 659 aa  137  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  23.45 
 
 		 671 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.7 
 
 		 646 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 673 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 695 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 714 aa  123  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 616 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 692 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.54 
 
 		 616 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 655 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 690 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  24.43 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 613 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 625 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.71 
 
 		 1023 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  23.23 
 
 		 623 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  24.96 
 
 		 666 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.8 
 
 		 666 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.8 
 
 		 666 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.8 
 
 		 666 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 626 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  23.16 
 
 		 611 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 634 aa  106  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 624 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 626 aa  103  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.66 
 
 		 666 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 628 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.82 
 
 		 663 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  24.83 
 
 		 671 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 		 613 aa  101  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 645 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  23.32 
 
 		 623 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 627 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 641 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  23 
 
 		 638 aa  98.2  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 611 aa  98.2  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 638 aa  97.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 613 aa  95.9  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 627 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 641 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  23.32 
 
 		 638 aa  95.5  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  22.78 
 
 		 627 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.71 
 
 		 620 aa  93.6  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 634 aa  93.2  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 679 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 612 aa  90.1  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 697 aa  88.2  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 593 aa  88.2  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  21.45 
 
 		 630 aa  87.8  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 697 aa  87.8  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 624 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  19.82 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  23.47 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 698 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 737 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.61 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.61 
 
 		 614 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.61 
 
 		 614 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.61 
 
 		 614 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.71 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 726 aa  78.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  21.94 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.07 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 649 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 713 aa  77  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.07 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 698 aa  77  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 698 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 698 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.07 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.07 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.84 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  23.34 
 
 		 680 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.07 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  23.15 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 632 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.85 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  22.13 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.24 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.36 
 
 		 685 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  23.36 
 
 		 685 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.36 
 
 		 685 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.36 
 
 		 685 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  23.36 
 
 		 685 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  21.46 
 
 		 627 aa  74.7  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>