More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1618 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48.21 
 
 		 227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  49.74 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  46.94 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.32 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  46 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  47.87 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  46.86 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  47.26 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  43.88 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  43.59 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.18 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  44.79 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  46 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 221 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 215 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  43.88 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  40.58 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  43 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  39.81 
 
 		 202 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.89 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  44.66 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  44.33 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 217 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  40.61 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  40.61 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  43.41 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  44.9 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  43.5 
 
 		 200 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 221 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  43.94 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  44.22 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.44 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  44.9 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  44.22 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>