More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4534 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4534  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 331 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  35.18 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  32.23 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  32.32 
 
 		 320 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  28.09 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  27.27 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 667 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.88 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 		 667 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 667 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  29.7 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  33.9 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  28.63 
 
 		 416 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 		 667 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  29.71 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  35.83 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  24.82 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  21.47 
 
 		 342 aa  89.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  21.15 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  36.6 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  32.57 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.97 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.61 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  27.31 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.03 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.45 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 468 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.45 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 		 665 aa  82.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  29.55 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.43 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.93 
 
 		 670 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  31.39 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.12 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  33.7 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  28.12 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  34.94 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.15 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  27.67 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  31.16 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  39.16 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.98 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  28.98 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  27.55 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 721 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  34.72 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.45 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  35.16 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.28 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  29.35 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  23.9 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  27.92 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  27.92 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  28.89 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  28.92 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>