212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4458 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  62.41 
 
 		 279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  62.27 
 
 		 279 aa  309  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  58.39 
 
 		 279 aa  308  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  58.39 
 
 		 279 aa  305  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  60.52 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 289 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  59.04 
 
 		 286 aa  298  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  58.46 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  59.49 
 
 		 280 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  59.62 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  60.44 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  53.7 
 
 		 281 aa  255  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  51.09 
 
 		 280 aa  251  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  46.67 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  47.83 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  47.79 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  45.77 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  46.01 
 
 		 301 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  41.61 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  39.56 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  41.18 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  40.58 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  37.91 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36.33 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  37.86 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  36.7 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  38.52 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  35.93 
 
 		 317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  36.4 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  36.09 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  33.98 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  35 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  39.86 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  36.07 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  36.4 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  36.09 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  36.8 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  36.03 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  36.63 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  35.16 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  35.66 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  38.61 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  37.73 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  36.4 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  35.36 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  35.4 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  36.75 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.42 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  36.23 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  33.83 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.04 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  35.32 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  35.2 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  35.79 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  36.1 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  35.27 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  36.26 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  36.14 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  33.8 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.4 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3065  helix-turn-helix domain protein  34.44 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  35.56 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  34.7 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>