More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3857 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 178 aa  346  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  53.21 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  47.66 
 
 		 156 aa  111  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  51.16 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  43.61 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  43.61 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  43.61 
 
 		 169 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  46.15 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  42.22 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  29.65 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  44.33 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  31.37 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  37.3 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  33.94 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  33.94 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  40.2 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0950  lipoprotein signal peptidase  39.67 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.06 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  32.28 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1099  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6224  lipoprotein signal peptidase  41.96 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  34.55 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  32.57 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2762  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  39.42 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  34.73 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  32.31 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  35.59 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  38.14 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  35.5 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  35.71 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  44.21 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.48 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  32.72 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  38.79 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  32.1 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.04 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  32.88 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1530  lipoprotein signal peptidase  35.54 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  38.79 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  36.62 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>