91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2569 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 227 aa  427  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.89 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  38.71 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.3 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  45.52 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 		 386 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  37.94 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 418 aa  65.1  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  39.31 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  34.3 
 
 		 708 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 362 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.93 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 424 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 372 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 		 295 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  36.89 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  31.47 
 
 		 422 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 		 362 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 807 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  23 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 280 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  35.83 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 415 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1024  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.708512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 615 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 417 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  48.33 
 
 		 330 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.88 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  38.81 
 
 		 397 aa  45.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  31.79 
 
 		 321 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  46.55 
 
 		 299 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 		 398 aa  45.1  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 		 345 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  31.53 
 
 		 470 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 		 466 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  37.68 
 
 		 340 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  37.14 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.68 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.15 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 494 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.56 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 395 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.04 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 393 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 349 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  29.91 
 
 		 407 aa  42  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  23.08 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 384 aa  41.6  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 403 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>