More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1229 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1229  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 623 aa  1238    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 684 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 658 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 701 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3188  threonyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 690 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 644 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2287  threonyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 691 aa  558  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14910  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 692 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 643 aa  553  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 657 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10670  threonyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 672 aa  548  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000327769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1919  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 677 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.615568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 657 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 682 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 614 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 649 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2043  threonyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 669 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000086336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1783  threonyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 670 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534298  normal  0.0885436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12633  threonyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 692 aa  538  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 644 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 673 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 684 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 684 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 684 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  45.06 
 
 		 676 aa  529  1e-149  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2317  threonyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 669 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1358  threonyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 685 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.462189 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 640 aa  526  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 659 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3838  threonyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 695 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.400381  normal  0.082381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 638 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 643 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 677 aa  526  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13900  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0274631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2558  threonyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3442  threonyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 699 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000446012  hitchhiker  0.0000744788 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  46.28 
 
 		 582 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 582 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 635 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 659 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 637 aa  513  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 645 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1979  threonyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 671 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000566637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 645 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17410  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  44.96 
 
 		 676 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.595758  normal  0.0835389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 644 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 638 aa  512  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 611 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 633 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 648 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 644 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 637 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  43.24 
 
 		 684 aa  506  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 636 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2392  threonyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 668 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451072  hitchhiker  0.00797277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3066  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 656 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.408536  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 635 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 662 aa  502  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 659 aa  505  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 636 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 636 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 643 aa  500  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 636 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 638 aa  501  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 637 aa  501  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 635 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 636 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 631 aa  495  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 646 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 604 aa  498  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 645 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 603 aa  498  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 647 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2370  threonyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 668 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1783  threonyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 671 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 646 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 640 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 634 aa  495  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1656  threonyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 583 aa  490  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 609 aa  491  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 634 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 640 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 637 aa  491  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 639 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 639 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1770  threonyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0365193  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 640 aa  486  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 638 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>