109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0854 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0854  putative signal transduction protein  100 
 
 		 223 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  38.12 
 
 		 283 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2176  putative signal transduction protein  31.84 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.173255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2489  diguanylate cyclase  30.41 
 
 		 836 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  28.35 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  24.74 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1012  putative signal transduction protein  28.95 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.38 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.92 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  24.23 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  24.23 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.97 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  28.46 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.19 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.19 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.19 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.19 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  26.34 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  27.36 
 
 		 305 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.06 
 
 		 397 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  25.41 
 
 		 366 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  27.13 
 
 		 302 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  28.11 
 
 		 661 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  25.26 
 
 		 290 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 407 aa  51.6  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 		 290 aa  51.6  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  29.53 
 
 		 852 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1928  putative signal transduction protein  31.58 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  25.13 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  27.34 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  43.33 
 
 		 422 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.8 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  24.16 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 282 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 291 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 324 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  24.73 
 
 		 438 aa  48.5  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  22.8 
 
 		 351 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  25.96 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.09 
 
 		 369 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  27.59 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  28.12 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  28.06 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 		 408 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  32.79 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 340 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 		 412 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0833  HDOD domain-contain protein  27.78 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.149096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  35.38 
 
 		 279 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 285 aa  45.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 292 aa  45.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  32.31 
 
 		 283 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.31 
 
 		 287 aa  45.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  26.88 
 
 		 289 aa  45.1  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 718 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  35.82 
 
 		 353 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  30.21 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  29.73 
 
 		 634 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  18.62 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  24.6 
 
 		 650 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  34.21 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  41.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  23.19 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  34.29 
 
 		 716 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  23.37 
 
 		 476 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 415 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2725  putative signal transduction protein  26.92 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  35.29 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  26.4 
 
 		 292 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  30.16 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 		 544 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  22.65 
 
 		 277 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  26.4 
 
 		 274 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.73 
 
 		 833 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  37.04 
 
 		 260 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2726  putative signal transduction protein  25.57 
 
 		 365 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.28 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  24.31 
 
 		 317 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25.5 
 
 		 496 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3873  Metal-dependent hydrolase HDOD  36.92 
 
 		 316 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.812708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>