More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0719 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  100 
 
 		 535 aa  1078    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  57.88 
 
 		 303 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  57.88 
 
 		 303 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  54.86 
 
 		 308 aa  297  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  54.29 
 
 		 311 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  51.79 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 306 aa  292  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  52.86 
 
 		 306 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  51.94 
 
 		 304 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  50.65 
 
 		 317 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  51.81 
 
 		 298 aa  289  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  52.92 
 
 		 334 aa  290  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  51.31 
 
 		 325 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  51.31 
 
 		 325 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  51.31 
 
 		 325 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 291 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  52.38 
 
 		 321 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  54.38 
 
 		 333 aa  287  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  51.46 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  51.82 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  51.82 
 
 		 339 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  54.74 
 
 		 328 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  48.47 
 
 		 302 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  52.55 
 
 		 337 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  50 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  48.99 
 
 		 308 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  51.09 
 
 		 305 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  50.68 
 
 		 332 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  51.18 
 
 		 342 aa  280  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  49.31 
 
 		 327 aa  280  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  51.1 
 
 		 321 aa  279  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  50.69 
 
 		 325 aa  279  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 316 aa  279  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 306 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 292 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 312 aa  279  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  48.33 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  47.52 
 
 		 336 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  48.33 
 
 		 315 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  48.86 
 
 		 324 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 328 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  51.05 
 
 		 298 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 312 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  53.11 
 
 		 308 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  50 
 
 		 355 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  47.37 
 
 		 329 aa  277  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  46.94 
 
 		 320 aa  277  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  47.3 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  47.3 
 
 		 373 aa  276  6e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 335 aa  276  7e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  50.55 
 
 		 318 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  51.46 
 
 		 341 aa  276  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 333 aa  276  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 294 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 292 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  48.92 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  55.6 
 
 		 294 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  51.22 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 339 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  52.42 
 
 		 291 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  51.27 
 
 		 297 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 347 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  50.69 
 
 		 330 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  48.18 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  48.18 
 
 		 335 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  49.66 
 
 		 324 aa  274  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  48.31 
 
 		 309 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 288 aa  273  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  47.02 
 
 		 320 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 324 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  51.04 
 
 		 325 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  48.54 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  47.93 
 
 		 307 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  48.54 
 
 		 311 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 283 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 321 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2176  lipoyl synthase  50.17 
 
 		 327 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0184  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  0.998847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0178  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  48.31 
 
 		 300 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  53.56 
 
 		 276 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  49.13 
 
 		 321 aa  270  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  270  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  49.48 
 
 		 322 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  48.08 
 
 		 322 aa  269  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 298 aa  269  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  50.37 
 
 		 299 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  46.39 
 
 		 300 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  48.08 
 
 		 322 aa  269  8.999999999999999e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 298 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  48.96 
 
 		 315 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  52.78 
 
 		 320 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>