More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3172 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
420 aa  838    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  93.1 
 
 
420 aa  780    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  74.21 
 
 
424 aa  624  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  73.85 
 
 
422 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  75.42 
 
 
431 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  62.72 
 
 
421 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  59.01 
 
 
425 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  58.26 
 
 
367 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  54.8 
 
 
450 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  56.79 
 
 
437 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  54 
 
 
417 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  53.83 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  53.83 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  53.58 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  54.25 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  54.61 
 
 
420 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  52.77 
 
 
421 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  48.34 
 
 
439 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175058 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  48.41 
 
 
1270 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  56 
 
 
427 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  45.71 
 
 
410 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  51.94 
 
 
575 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  53.75 
 
 
405 aa  358  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  45.66 
 
 
443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  46.75 
 
 
471 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  46.5 
 
 
470 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  47.7 
 
 
653 aa  325  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  43.77 
 
 
430 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  43.77 
 
 
430 aa  322  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  45.95 
 
 
437 aa  322  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  48.39 
 
 
442 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  42.26 
 
 
446 aa  316  5e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  44.33 
 
 
453 aa  316  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  43.73 
 
 
438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  48.75 
 
 
426 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  44.8 
 
 
438 aa  312  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  41.63 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  42.57 
 
 
445 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  46.98 
 
 
437 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  47.25 
 
 
426 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  42.69 
 
 
447 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  40.35 
 
 
441 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  43.64 
 
 
444 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  42.57 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  44.17 
 
 
428 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  42.65 
 
 
419 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  44.13 
 
 
406 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.6 
 
 
438 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  39.31 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  44.7 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  39.31 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  42.12 
 
 
394 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  38.82 
 
 
466 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  45.3 
 
 
405 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  44.41 
 
 
394 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  38.52 
 
 
459 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  44.7 
 
 
394 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  43.92 
 
 
389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.61 
 
 
439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  44.13 
 
 
394 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  44.13 
 
 
394 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  44.13 
 
 
394 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  43.6 
 
 
412 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  41.31 
 
 
480 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  44.21 
 
 
389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  41.06 
 
 
391 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  38.35 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  38.35 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  41.6 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.73 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  41.57 
 
 
387 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  48.63 
 
 
391 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  41.22 
 
 
393 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  38.11 
 
 
471 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  41.05 
 
 
387 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  40.05 
 
 
458 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  45.73 
 
 
384 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  42.69 
 
 
396 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  41.05 
 
 
387 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  41.05 
 
 
387 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  41.06 
 
 
449 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  43.68 
 
 
388 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  41.05 
 
 
387 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.16 
 
 
431 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  43.49 
 
 
395 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.78 
 
 
435 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  38.35 
 
 
470 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  42.12 
 
 
396 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  42.12 
 
 
396 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  42.12 
 
 
396 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  36.25 
 
 
432 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  42.12 
 
 
396 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.12 
 
 
396 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  42.12 
 
 
396 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  42.12 
 
 
396 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  41.6 
 
 
387 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  35.91 
 
 
437 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  44.65 
 
 
389 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  35.83 
 
 
449 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  38.53 
 
 
438 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>