More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1061 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
351 aa  704    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  59.21 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  57.4 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  56.89 
 
 
344 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  58.31 
 
 
344 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  50.16 
 
 
343 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  42.73 
 
 
344 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  38.4 
 
 
347 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  34.43 
 
 
341 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  34.02 
 
 
336 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  33.33 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  32.36 
 
 
368 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 
349 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
353 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
347 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.9 
 
 
331 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 
360 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  25.52 
 
 
350 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.32 
 
 
353 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  26.95 
 
 
363 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
350 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
387 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
328 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 
356 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
355 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
366 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  27.56 
 
 
376 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  27.56 
 
 
376 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.12 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 
350 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
362 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.6 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.18 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 
350 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  26.3 
 
 
387 aa  96.7  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
359 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
328 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  28.28 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 
360 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 
352 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 
360 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  23.3 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  24.14 
 
 
438 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  29.94 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
435 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.63 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 
378 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  22.77 
 
 
337 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
377 aa  92.8  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
359 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  25.56 
 
 
339 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
350 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
337 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  26.87 
 
 
366 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
355 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.55 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3270  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  25.43 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 
356 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  23.31 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
435 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
387 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 
341 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
345 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 
368 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
345 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.33 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  24.36 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.82 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
358 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  27.22 
 
 
386 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 
363 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  31.7 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>