More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2340 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 343 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  54.41 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  54.9 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  55.32 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  50.74 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  50.9 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  50.6 
 
 		 367 aa  361  9e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  52.29 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  54.71 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  52.23 
 
 		 361 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  52.66 
 
 		 371 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  55.24 
 
 		 317 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  51.61 
 
 		 372 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  53.52 
 
 		 371 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  53.75 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  53.61 
 
 		 379 aa  351  8.999999999999999e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.85 
 
 		 372 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.51 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 		 329 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  53.13 
 
 		 376 aa  349  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  52.89 
 
 		 364 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  52.66 
 
 		 340 aa  348  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  52.89 
 
 		 378 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  51.19 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 358 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  51.33 
 
 		 342 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  52.29 
 
 		 367 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  51.37 
 
 		 375 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  51.51 
 
 		 383 aa  342  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  51.2 
 
 		 375 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  53.19 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 380 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.58 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  50.46 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 380 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 369 aa  338  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  51.98 
 
 		 349 aa  338  7e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  50.74 
 
 		 370 aa  338  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 380 aa  338  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  51.05 
 
 		 376 aa  338  9e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 332 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.35 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  52.28 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  50.59 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 375 aa  335  5e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  50.93 
 
 		 331 aa  335  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  52.65 
 
 		 332 aa  335  5.999999999999999e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 364 aa  335  9e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  47.88 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  51.96 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  55.02 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.58 
 
 		 365 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 376 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  50.76 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 327 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 364 aa  332  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  50.15 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  49.24 
 
 		 367 aa  332  8e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  54.26 
 
 		 322 aa  332  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  51.83 
 
 		 372 aa  331  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  47.09 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  50.31 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  50.76 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  51.21 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  50 
 
 		 378 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  47.71 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  51.08 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  51.09 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  48.66 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  50.9 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  49.27 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  50.78 
 
 		 325 aa  330  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  52.15 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  50.94 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  47.32 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  49.4 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  51.37 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 		 337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  50.46 
 
 		 365 aa  328  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1742  hypothetical protein  53.8 
 
 		 335 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  50.45 
 
 		 376 aa  328  9e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  51.06 
 
 		 374 aa  328  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  51.25 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  54.9 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  48.51 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  47.42 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>