More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4577 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5045  transcriptional regulator, TetR family  42.14 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  46.53 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3888  transcriptional regulator, TetR family  46.73 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  42.99 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  49.07 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2217  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  41.96 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5046  putative transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  36.7 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4046  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0577421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  41.44 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  37.04 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  39.62 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  31.06 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  49.3 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5223  putative transcriptional regulator, TetR family  45.63 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  43.75 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>