More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3067 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3067  DNA polymerase IV  100 
 
 		 351 aa  701    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2021  DNA polymerase IV  80.91 
 
 		 357 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5822  DNA polymerase IV  57.23 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  56.16 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  53.89 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4310  DNA polymerase IV  52.92 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  51.6 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1036  DNA polymerase IV  55.62 
 
 		 353 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.165009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1793  DNA polymerase IV  51.9 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624184  normal  0.997558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1812  DNA polymerase IV  51.9 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1859  DNA polymerase IV  51.9 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0489  DNA polymerase IV  49.26 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13073  DNA polymerase IV  47.94 
 
 		 346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.498558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1153  DNA-directed DNA polymerase  45.83 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  39.49 
 
 		 417 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  34.62 
 
 		 395 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  37.61 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  37.85 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  33.24 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  33.23 
 
 		 393 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  36.98 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  35.03 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 		 424 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.39 
 
 		 419 aa  162  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  32.77 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  29.55 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  36.14 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  32.68 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  32.34 
 
 		 416 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.23 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  36.96 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  31.44 
 
 		 431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  31.93 
 
 		 385 aa  156  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  31.9 
 
 		 403 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  33.71 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.47 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  32.49 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  34.16 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  31.69 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  32.66 
 
 		 408 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.76 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  32.43 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  34.99 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  29.68 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  32.35 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.34 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  32.04 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  35.53 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  35.53 
 
 		 378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  32.95 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  31.71 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  35.43 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  35.62 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  31.47 
 
 		 425 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  31.21 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  35.43 
 
 		 418 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  32.35 
 
 		 390 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  34.02 
 
 		 363 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 408 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2961  DNA-directed DNA polymerase  27.43 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  33.23 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  32.35 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  35.1 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  32.56 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  31.78 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  31.55 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  31.83 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  33.82 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2166  DNA-directed DNA polymerase  33.55 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  31.47 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  33.05 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  33.05 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  30.53 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.48 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  29.13 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  34.86 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  33.71 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  34.02 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  34.28 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  34.65 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  29.23 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  33.9 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  35.2 
 
 		 834 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.02 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  34.12 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.26 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  31.71 
 
 		 413 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  33.99 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  34.39 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  30.68 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  33.24 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>