More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3037 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3037  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 318 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.974968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0119  carbohydrate kinase, YjeF related protein  64.26 
 
 		 324 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1301  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.68 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0119511  decreased coverage  0.000369396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3700  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.13 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.562936  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5173  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.43 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235734  normal  0.234925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4707  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.43 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5246  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.77 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0182  hypothetical protein  38.49 
 
 		 293 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0742  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.98 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 512 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.59 
 
 		 528 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  31.53 
 
 		 512 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3050  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.19 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.17 
 
 		 519 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.91 
 
 		 516 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.94 
 
 		 510 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.82 
 
 		 556 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  31.61 
 
 		 504 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  28.48 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  31.61 
 
 		 504 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.76 
 
 		 517 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  29.19 
 
 		 524 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  31.29 
 
 		 504 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.65 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  30.32 
 
 		 493 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.15 
 
 		 498 aa  99.8  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  30.32 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.33 
 
 		 530 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.26 
 
 		 521 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36 
 
 		 511 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.54 
 
 		 524 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.62 
 
 		 516 aa  95.9  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 		 499 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.78 
 
 		 515 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.67 
 
 		 532 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.8 
 
 		 533 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.26 
 
 		 436 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  30.82 
 
 		 514 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.56 
 
 		 509 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  29.84 
 
 		 503 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  34.48 
 
 		 506 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  29.61 
 
 		 515 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  29.61 
 
 		 515 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.15 
 
 		 556 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  29.84 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  29.28 
 
 		 515 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.71 
 
 		 512 aa  92.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.28 
 
 		 515 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  29.28 
 
 		 515 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  29.28 
 
 		 510 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  29.28 
 
 		 510 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  29.28 
 
 		 515 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.69 
 
 		 530 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  23.81 
 
 		 499 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  28.76 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  29.67 
 
 		 510 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  29.97 
 
 		 462 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  30.9 
 
 		 513 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.02 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  31.09 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  31.09 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  31.09 
 
 		 514 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.22 
 
 		 501 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.38 
 
 		 509 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  31.09 
 
 		 514 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  31.09 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.11 
 
 		 524 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  30.42 
 
 		 508 aa  85.9  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.68 
 
 		 504 aa  85.9  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.7 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.84 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0585  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.45 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  24.49 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.5 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.88 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  30.67 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.45 
 
 		 546 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.05 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  27.09 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.41 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.75 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.48 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.37 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.44 
 
 		 520 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  29.04 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.76 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  32.28 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.72 
 
 		 494 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  32.28 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.85 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.72 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.36 
 
 		 521 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.34 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.82 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.03 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 		 518 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.45 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.82 
 
 		 492 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>