More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1120 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1120  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  59.83 
 
 
243 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  55.6 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  56 
 
 
260 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.32 
 
 
243 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2272  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.74 
 
 
253 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2374  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.74 
 
 
253 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.90212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
244 aa  267  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  56.49 
 
 
252 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  54.92 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  55.65 
 
 
250 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  56.67 
 
 
243 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.05 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.05 
 
 
254 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2033  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  57.32 
 
 
253 aa  264  8.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  52.21 
 
 
254 aa  263  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.37 
 
 
259 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  55.16 
 
 
243 aa  262  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
267 aa  262  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.46 
 
 
250 aa  261  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  53.36 
 
 
242 aa  261  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.92 
 
 
250 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0356  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.07 
 
 
247 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  55.23 
 
 
241 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  53.23 
 
 
256 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 
240 aa  260  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
244 aa  260  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.8 
 
 
263 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  51 
 
 
240 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  55.46 
 
 
259 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.68 
 
 
250 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  52.4 
 
 
246 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.38 
 
 
592 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.76 
 
 
244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.68 
 
 
250 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.68 
 
 
250 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  56.68 
 
 
250 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 
257 aa  258  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 
595 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
240 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.97 
 
 
241 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  53.6 
 
 
246 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  54.39 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  54.39 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.23 
 
 
241 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.23 
 
 
241 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  56.07 
 
 
248 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.23 
 
 
241 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  54.17 
 
 
241 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.14 
 
 
252 aa  256  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 
254 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5182  cystine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.65 
 
 
247 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  57.58 
 
 
273 aa  255  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  54.11 
 
 
265 aa  255  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.4 
 
 
242 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  56.41 
 
 
258 aa  255  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.37 
 
 
249 aa  255  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.41 
 
 
244 aa  255  5e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  53.33 
 
 
274 aa  254  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  52.8 
 
 
248 aa  254  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.69 
 
 
250 aa  254  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  55.65 
 
 
248 aa  254  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  55.04 
 
 
256 aa  254  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 
240 aa  254  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  53.97 
 
 
243 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  52.17 
 
 
262 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  53.56 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  54.37 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  51.81 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  47.97 
 
 
264 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  50.8 
 
 
242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  56.65 
 
 
256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  55.23 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  55.23 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.39 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  54.58 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  49.8 
 
 
259 aa  252  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.66 
 
 
260 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
259 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  50.2 
 
 
275 aa  252  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.2 
 
 
242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.2 
 
 
240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
244 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  54.62 
 
 
261 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  53.75 
 
 
243 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  53.69 
 
 
251 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
244 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  51.2 
 
 
255 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  53.39 
 
 
251 aa  251  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  53.36 
 
 
260 aa  251  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
244 aa  251  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.3 
 
 
244 aa  251  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.39 
 
 
263 aa  251  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  52.42 
 
 
252 aa  251  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  54.69 
 
 
250 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>