More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0663 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
154 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  29.01 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  30.61 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  36.21 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.15 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  27.91 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  30.6 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  30.6 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  35.4 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  34.29 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  33.57 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  30.47 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  26.72 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  32.09 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  26.77 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  31.09 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  29.66 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  28.99 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>