More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3035 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 880 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 876 aa  980    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 876 aa  979    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 876 aa  914    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0508  alanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 887 aa  747    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 875 aa  795    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 874 aa  936    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 876 aa  980    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 879 aa  711    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 876 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 880 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 876 aa  981    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  91.6 
 
 		 874 aa  767    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 905 aa  720    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 865 aa  865    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 874 aa  934    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  81.2 
 
 		 874 aa  767    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 880 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 880 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 880 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  65.84 
 
 		 874 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 897 aa  938    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 903 aa  904    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 863 aa  896    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 876 aa  978    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 872 aa  956    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2405  alanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 901 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.665825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 874 aa  1003    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0146  alanyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 891 aa  652    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00216765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 880 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 896 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 880 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  50.79 
 
 		 873 aa  895    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 874 aa  935    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 892 aa  922    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 882 aa  789    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  65.27 
 
 		 897 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 879 aa  741    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 891 aa  777    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  89.24 
 
 		 874 aa  727    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 		 874 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 876 aa  782    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  68.34 
 
 		 875 aa  664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 880 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 880 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 876 aa  978    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 874 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 881 aa  734    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  66.22 
 
 		 874 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 905 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 883 aa  803    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  65.84 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 874 aa  954    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  70.39 
 
 		 875 aa  646    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000779189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  54.57 
 
 		 876 aa  976    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 891 aa  778    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  71.81 
 
 		 876 aa  1354    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 874 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 890 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 874 aa  1204    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  76.29 
 
 		 878 aa  713    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 874 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 904 aa  768    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 891 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 868 aa  912    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 931 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 890 aa  804    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  77.93 
 
 		 884 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0205  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 884 aa  804    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 875 aa  742    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 882 aa  940    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 883 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  65.84 
 
 		 897 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 876 aa  979    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 876 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 876 aa  978    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 874 aa  754    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 876 aa  978    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 875 aa  922    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 887 aa  765    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  0.000000000232232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 876 aa  783    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 		 874 aa  942    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 897 aa  932    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1008  alanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 884 aa  739    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 874 aa  659    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 892 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  53.34 
 
 		 897 aa  934    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 865 aa  869    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  65.84 
 
 		 897 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  73.37 
 
 		 872 aa  745    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 888 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  64.3 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  64.88 
 
 		 874 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 878 aa  753    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3035  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 948 aa  1942    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12081  normal  0.0855444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 892 aa  961    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>