More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2588 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  77.78 
 
 
324 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  73.77 
 
 
322 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  72.53 
 
 
322 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  73.85 
 
 
325 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  75.16 
 
 
322 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  75.16 
 
 
322 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  73.4 
 
 
317 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  66.06 
 
 
333 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0972  hypothetical protein  71.28 
 
 
320 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0157499  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  64.55 
 
 
333 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.37 
 
 
325 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.94 
 
 
335 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.53 
 
 
328 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.43 
 
 
328 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.19 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.14 
 
 
330 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.24 
 
 
328 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.42 
 
 
344 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 
328 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.61 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.62 
 
 
331 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  44.15 
 
 
322 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.61 
 
 
322 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.43 
 
 
329 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.95 
 
 
339 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 
322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.43 
 
 
328 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.27 
 
 
358 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  43.52 
 
 
329 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.99 
 
 
330 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.48 
 
 
323 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.19 
 
 
327 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.99 
 
 
330 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.75 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.28 
 
 
343 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 
331 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.43 
 
 
328 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.11 
 
 
304 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.28 
 
 
338 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.81 
 
 
327 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41 
 
 
324 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 
327 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.81 
 
 
325 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.31 
 
 
326 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.75 
 
 
346 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.49 
 
 
322 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.5 
 
 
322 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  39.82 
 
 
339 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.87 
 
 
334 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.76 
 
 
335 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  42.05 
 
 
326 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  43.03 
 
 
327 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.6 
 
 
325 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.18 
 
 
328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.72 
 
 
333 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.94 
 
 
339 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  41.95 
 
 
317 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.36 
 
 
349 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.19 
 
 
332 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  41.95 
 
 
317 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  39.51 
 
 
334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.14 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.29 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  41.39 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 
329 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  44.52 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.8 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.45 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.94 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.13 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.85 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.13 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.18 
 
 
332 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.8 
 
 
332 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  39.88 
 
 
341 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.22 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.44 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.54 
 
 
318 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.7 
 
 
330 aa  241  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  40.67 
 
 
331 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  42.23 
 
 
327 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.13 
 
 
341 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.92 
 
 
337 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.04 
 
 
351 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  40.24 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.94 
 
 
336 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  40.46 
 
 
331 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.38 
 
 
323 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.23 
 
 
336 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  39.12 
 
 
324 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.13 
 
 
328 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.01 
 
 
324 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.14 
 
 
322 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.37 
 
 
353 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  41.53 
 
 
302 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  38.19 
 
 
330 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  38.31 
 
 
342 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 
326 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  38.82 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>