More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2723 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  71.18 
 
 
231 aa  341  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  74.12 
 
 
232 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 
232 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  67.54 
 
 
231 aa  324  8.000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 
230 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  65.78 
 
 
231 aa  318  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  71.24 
 
 
233 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  66.08 
 
 
233 aa  314  6e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  70.82 
 
 
233 aa  314  9e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  69 
 
 
230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  68.42 
 
 
229 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  72.44 
 
 
230 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  72.89 
 
 
230 aa  309  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  72.89 
 
 
230 aa  309  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  72.89 
 
 
230 aa  309  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  72.89 
 
 
230 aa  309  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  72.89 
 
 
230 aa  309  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  72.44 
 
 
230 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  72.89 
 
 
230 aa  309  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  72.89 
 
 
230 aa  309  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  72.44 
 
 
230 aa  308  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  69 
 
 
231 aa  308  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  64.63 
 
 
235 aa  307  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  66.06 
 
 
233 aa  307  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 
230 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 
230 aa  306  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  71.56 
 
 
230 aa  304  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  66.96 
 
 
230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  64.89 
 
 
233 aa  301  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 
229 aa  300  1e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  68.58 
 
 
229 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  68.58 
 
 
229 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  62.67 
 
 
233 aa  299  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 
234 aa  299  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  62.5 
 
 
233 aa  299  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  62.67 
 
 
234 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  66.38 
 
 
230 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  62.11 
 
 
232 aa  295  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  63.06 
 
 
233 aa  295  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 
234 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  64.44 
 
 
234 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 
233 aa  294  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  67.3 
 
 
234 aa  294  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  62.83 
 
 
235 aa  294  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  62.61 
 
 
233 aa  292  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 
234 aa  291  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  59.23 
 
 
242 aa  292  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  65.2 
 
 
230 aa  291  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  60.96 
 
 
235 aa  290  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  60.44 
 
 
235 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 
230 aa  289  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  60.17 
 
 
241 aa  288  6e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  60.53 
 
 
233 aa  288  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  56.96 
 
 
235 aa  287  9e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  61.78 
 
 
236 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  58.41 
 
 
234 aa  285  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 
233 aa  284  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  58.7 
 
 
233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 
232 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  61.78 
 
 
232 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  61.5 
 
 
236 aa  281  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  63.11 
 
 
231 aa  281  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  56.96 
 
 
232 aa  281  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  60.53 
 
 
242 aa  281  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  59.21 
 
 
236 aa  280  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 
232 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 
229 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 
229 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 
232 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 
232 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  60.89 
 
 
232 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 
232 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 
232 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  60.44 
 
 
232 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 
226 aa  277  1e-73  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 
229 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  58.22 
 
 
234 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  62.61 
 
 
236 aa  277  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000284572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  57.64 
 
 
232 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  56.19 
 
 
234 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 
227 aa  275  3e-73  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  58.59 
 
 
231 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  58.3 
 
 
238 aa  275  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  58.74 
 
 
230 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0309  50S ribosomal protein L1  58.3 
 
 
253 aa  275  6e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000338213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  61.29 
 
 
235 aa  274  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  58.3 
 
 
238 aa  274  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  58.85 
 
 
231 aa  274  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  60 
 
 
232 aa  274  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 
235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>