115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2624 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  100 
 
 
546 aa  1082    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.89 
 
 
544 aa  242  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  28.85 
 
 
549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  29.35 
 
 
547 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.38 
 
 
544 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.38 
 
 
544 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  29.68 
 
 
549 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  29.56 
 
 
544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  30.24 
 
 
547 aa  233  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  29.6 
 
 
547 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  28.12 
 
 
439 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  30.55 
 
 
560 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 
564 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  29.04 
 
 
565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  28.89 
 
 
578 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  25.79 
 
 
663 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  27.13 
 
 
559 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  25.89 
 
 
577 aa  90.1  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.43 
 
 
613 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  28.1 
 
 
590 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  33.9 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  26.8 
 
 
697 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.21 
 
 
208 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  31.93 
 
 
124 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  26.64 
 
 
632 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.09 
 
 
124 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.09 
 
 
124 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.09 
 
 
124 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.09 
 
 
124 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.09 
 
 
124 aa  63.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.09 
 
 
124 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  29.13 
 
 
124 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.09 
 
 
124 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  29.13 
 
 
124 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  20.18 
 
 
927 aa  61.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  34.82 
 
 
188 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 
128 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30.25 
 
 
124 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 
128 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 
128 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  29.13 
 
 
124 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  29.75 
 
 
869 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  29.13 
 
 
124 aa  60.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  29.13 
 
 
124 aa  60.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  27.69 
 
 
126 aa  60.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  24.58 
 
 
649 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  32.28 
 
 
174 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  32.28 
 
 
174 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 
124 aa  58.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 
173 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  33.62 
 
 
182 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 
174 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 
118 aa  57  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 
119 aa  57  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 
208 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  29.68 
 
 
588 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 
172 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 
528 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  35.54 
 
 
210 aa  55.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
178 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  29.36 
 
 
127 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  36.97 
 
 
571 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  28.65 
 
 
687 aa  54.3  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 
144 aa  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 
203 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  27.04 
 
 
513 aa  52  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  30.63 
 
 
223 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 
172 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 
189 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  28 
 
 
125 aa  50.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.86 
 
 
217 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  31.37 
 
 
593 aa  50.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.13 
 
 
233 aa  50.4  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  28.97 
 
 
121 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 
170 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 
607 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  32.43 
 
 
519 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  31.37 
 
 
197 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  25.4 
 
 
143 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 
226 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  26.23 
 
 
122 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  30.12 
 
 
207 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 
206 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  30.25 
 
 
184 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 
284 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 
226 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  32.46 
 
 
210 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  25.74 
 
 
126 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  25.74 
 
 
126 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  25.74 
 
 
126 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  29.7 
 
 
106 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  28.68 
 
 
141 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  28.68 
 
 
141 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  30.53 
 
 
708 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 
121 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  32 
 
 
180 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 
121 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 
121 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  28.97 
 
 
133 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 
551 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>