More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04308 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  100 
 
 
296 aa  608  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  52.53 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  53.05 
 
 
245 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  50.69 
 
 
290 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
317 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  50.7 
 
 
240 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  50.7 
 
 
240 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  50.23 
 
 
239 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  52.13 
 
 
268 aa  202  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  51.8 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  52.09 
 
 
239 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 
246 aa  199  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 
246 aa  199  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 
241 aa  198  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  48.84 
 
 
242 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  48.82 
 
 
213 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  47.91 
 
 
246 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  47.91 
 
 
251 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 
213 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 
246 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  48.37 
 
 
251 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  46.54 
 
 
237 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34483  predicted protein  48.84 
 
 
262 aa  188  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000711163 
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  46.54 
 
 
237 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  48.37 
 
 
239 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 
213 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  45.62 
 
 
246 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  45.62 
 
 
246 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 
241 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 
238 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  47.47 
 
 
241 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  48.37 
 
 
245 aa  185  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  47 
 
 
241 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  47.47 
 
 
241 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  48.37 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  46.98 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  46.98 
 
 
228 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  46.98 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  46.98 
 
 
240 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  47.96 
 
 
229 aa  182  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  48.82 
 
 
251 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  45.65 
 
 
257 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 
243 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  47.96 
 
 
227 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  45.62 
 
 
227 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  49.3 
 
 
211 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
219 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  46.7 
 
 
219 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  47.17 
 
 
219 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  47.14 
 
 
217 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  45.97 
 
 
220 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  44.19 
 
 
218 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  46.92 
 
 
214 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2372  ribosomal protein L3  44.76 
 
 
211 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  44.55 
 
 
216 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 
219 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
216 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  45.25 
 
 
231 aa  165  8e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  46.7 
 
 
308 aa  165  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  44.39 
 
 
226 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  45.67 
 
 
218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  43.93 
 
 
218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  43.93 
 
 
217 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  46.41 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 
216 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
216 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  44.5 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 
212 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  44.81 
 
 
214 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  45.24 
 
 
212 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
211 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
211 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 
212 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
211 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  42.99 
 
 
217 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 
212 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  42.99 
 
 
217 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  42.99 
 
 
217 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  44.5 
 
 
213 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
209 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  44.02 
 
 
219 aa  159  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  43.81 
 
 
214 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 
212 aa  158  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  45.41 
 
 
209 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 
211 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  44.98 
 
 
209 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  42.18 
 
 
216 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  45.85 
 
 
211 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  43.33 
 
 
217 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  42.06 
 
 
213 aa  156  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0328  ribosomal protein L3  41.15 
 
 
212 aa  157  3e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 
218 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  44.02 
 
 
211 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  44.02 
 
 
211 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  42.58 
 
 
218 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 
213 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  42.11 
 
 
212 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  42.86 
 
 
215 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0409  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 
231 aa  155  7e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.214097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>