More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1596 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1501  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  98.62 
 
 
218 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2363  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  96.77 
 
 
219 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0158273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1506  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  87.1 
 
 
218 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.233777  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.22 
 
 
229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.92 
 
 
220 aa  298  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.81 
 
 
218 aa  294  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.81 
 
 
218 aa  294  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.11 
 
 
218 aa  288  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.81 
 
 
222 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  66.02 
 
 
218 aa  286  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.67 
 
 
221 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  66.03 
 
 
209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
268 aa  285  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.35 
 
 
255 aa  285  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.29 
 
 
213 aa  284  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.99 
 
 
221 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.81 
 
 
213 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.38 
 
 
219 aa  281  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  67 
 
 
209 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  59.72 
 
 
218 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  64.76 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  64.76 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  64.76 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  64.76 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.03 
 
 
224 aa  280  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  64.76 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  64.76 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  64.76 
 
 
213 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.26 
 
 
218 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.26 
 
 
218 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  58.99 
 
 
218 aa  278  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  59.91 
 
 
218 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.07 
 
 
215 aa  279  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  59.91 
 
 
218 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.8 
 
 
218 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.8 
 
 
218 aa  277  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.34 
 
 
211 aa  277  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  59.26 
 
 
218 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.47 
 
 
218 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.29 
 
 
213 aa  276  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.71 
 
 
215 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  63.81 
 
 
213 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.99 
 
 
218 aa  275  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  58.99 
 
 
218 aa  275  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.7 
 
 
212 aa  275  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.99 
 
 
218 aa  275  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.57 
 
 
212 aa  274  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.41 
 
 
220 aa  274  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.41 
 
 
219 aa  274  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  57.14 
 
 
218 aa  274  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.41 
 
 
220 aa  274  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.21 
 
 
212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.09 
 
 
219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.86 
 
 
202 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.18 
 
 
222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.53 
 
 
213 aa  272  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.33 
 
 
213 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.04 
 
 
213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.8 
 
 
218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.53 
 
 
217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  58.99 
 
 
218 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  56.94 
 
 
221 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.32 
 
 
209 aa  271  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.33 
 
 
213 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.73 
 
 
216 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.53 
 
 
218 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.87 
 
 
218 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.68 
 
 
213 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.91 
 
 
218 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.91 
 
 
218 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.91 
 
 
218 aa  269  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.38 
 
 
213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.29 
 
 
215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  62.26 
 
 
212 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  59.91 
 
 
218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.98 
 
 
212 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  60 
 
 
217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.32 
 
 
217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.38 
 
 
213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.6 
 
 
218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.38 
 
 
213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.56 
 
 
210 aa  268  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.15 
 
 
212 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.33 
 
 
214 aa  268  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.19 
 
 
214 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.87 
 
 
218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.87 
 
 
218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.87 
 
 
218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.87 
 
 
218 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.43 
 
 
218 aa  267  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.56 
 
 
209 aa  267  8.999999999999999e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.29 
 
 
216 aa  266  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.06 
 
 
209 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.34 
 
 
221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.18 
 
 
228 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.15 
 
 
211 aa  265  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.15 
 
 
223 aa  265  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.42 
 
 
218 aa  264  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  61.03 
 
 
216 aa  264  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>