More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3045 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1168    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  99.82 
 
 		 567 aa  1167    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  99.29 
 
 		 567 aa  1162    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  63.3 
 
 		 575 aa  729    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  46.71 
 
 		 566 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  46.36 
 
 		 566 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 		 566 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 		 566 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  46.54 
 
 		 566 aa  527  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  46.18 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  46.18 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  46.18 
 
 		 566 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  46.36 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  45.39 
 
 		 566 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  45.21 
 
 		 566 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  45.39 
 
 		 566 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  45.21 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  45.65 
 
 		 566 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.8 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  26.47 
 
 		 553 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  25.65 
 
 		 565 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.47 
 
 		 596 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.3 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.3 
 
 		 596 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  27.19 
 
 		 553 aa  179  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  27.19 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  27.19 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.3 
 
 		 596 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  26.18 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  26.56 
 
 		 555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  26 
 
 		 551 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  26 
 
 		 551 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  26.34 
 
 		 552 aa  173  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  26.63 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  26.09 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  26 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  26 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  26 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  25.22 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  25.83 
 
 		 551 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 569 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  25.83 
 
 		 553 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  25.82 
 
 		 552 aa  163  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  26.31 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  25.39 
 
 		 552 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  24.53 
 
 		 569 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  25.65 
 
 		 552 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  26.13 
 
 		 552 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  24.02 
 
 		 568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 495 aa  146  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  22.83 
 
 		 637 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  22.79 
 
 		 559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  21.66 
 
 		 585 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  20.17 
 
 		 578 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  20.88 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  20.47 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  19.9 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  20.28 
 
 		 571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.99 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  20.96 
 
 		 578 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  21.67 
 
 		 536 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  20.1 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  19.59 
 
 		 578 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.76 
 
 		 579 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  20.1 
 
 		 578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.91 
 
 		 579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  20.1 
 
 		 578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.85 
 
 		 579 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.27 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  20.3 
 
 		 578 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  27.57 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  27.57 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  26.97 
 
 		 345 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  30.49 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.05 
 
 		 569 aa  82  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.02 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.27 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  21.38 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0191  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.29 
 
 		 511 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.12 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.22 
 
 		 531 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  27.57 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.78 
 
 		 511 aa  67  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.73 
 
 		 511 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 536 aa  65.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  25 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4335  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.83307  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  19 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>