More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1103 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  63.3 
 
 		 567 aa  745    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  63.48 
 
 		 567 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  63.65 
 
 		 567 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 575 aa  1159    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  49.56 
 
 		 566 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  49.56 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  49.91 
 
 		 566 aa  548  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  49.73 
 
 		 566 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  49.73 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  49.38 
 
 		 566 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  49.38 
 
 		 566 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 566 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  49.38 
 
 		 566 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  49.03 
 
 		 566 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  49.03 
 
 		 566 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  49.2 
 
 		 566 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  49.03 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  49.91 
 
 		 566 aa  541  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  27.94 
 
 		 555 aa  209  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  28.55 
 
 		 553 aa  206  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  27.08 
 
 		 565 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  27.59 
 
 		 553 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  26.94 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  27.62 
 
 		 553 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  27.62 
 
 		 553 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  27.62 
 
 		 553 aa  194  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  26.66 
 
 		 551 aa  193  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  27.26 
 
 		 552 aa  193  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  26.66 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  26.66 
 
 		 551 aa  192  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  26.48 
 
 		 551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  26.31 
 
 		 551 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  26.31 
 
 		 551 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  27.4 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  25.04 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  27.02 
 
 		 552 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.76 
 
 		 596 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  27.02 
 
 		 552 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.76 
 
 		 596 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  26.84 
 
 		 552 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  26.84 
 
 		 552 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.76 
 
 		 596 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.59 
 
 		 596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  26.13 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.76 
 
 		 596 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  26.67 
 
 		 552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  24.74 
 
 		 569 aa  183  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  26 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  24.24 
 
 		 568 aa  171  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  25.13 
 
 		 559 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  23.58 
 
 		 585 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 495 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  22.63 
 
 		 589 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 578 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 		 571 aa  143  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  22.63 
 
 		 578 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 578 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 578 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  24.02 
 
 		 637 aa  140  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  20.83 
 
 		 578 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  20.83 
 
 		 578 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  21.63 
 
 		 578 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 563 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  21.63 
 
 		 578 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  23.13 
 
 		 536 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  20.83 
 
 		 578 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  27.69 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  20.46 
 
 		 579 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  20.38 
 
 		 579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  20.38 
 
 		 579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.68 
 
 		 579 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.68 
 
 		 586 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.91 
 
 		 579 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 579 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 579 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.41 
 
 		 569 aa  93.6  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  19.41 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.07 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.07 
 
 		 534 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 		 554 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.28 
 
 		 524 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3852  extracellular solute-binding protein family 5  23.59 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000990708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.17 
 
 		 532 aa  72  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.02 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  24.61 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  22.63 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.19 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  25.89 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.19 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  30.94 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 545 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>