More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0912 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  70.8 
 
 
566 aa  832    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  70.97 
 
 
566 aa  830    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  70.97 
 
 
566 aa  833    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
566 aa  1162    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  71.15 
 
 
566 aa  836    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  74.16 
 
 
566 aa  885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  70.8 
 
 
566 aa  832    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  70.97 
 
 
566 aa  835    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  71.33 
 
 
566 aa  837    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  70.8 
 
 
566 aa  832    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  74.16 
 
 
566 aa  883    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  74.16 
 
 
566 aa  884    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  73.98 
 
 
566 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  71.15 
 
 
566 aa  836    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  49.91 
 
 
575 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  45.83 
 
 
567 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  45.65 
 
 
567 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  45.65 
 
 
567 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  30.33 
 
 
553 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  28.62 
 
 
553 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  28.62 
 
 
553 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  28.62 
 
 
553 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  29.53 
 
 
596 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  29.22 
 
 
596 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  29.53 
 
 
596 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  29.24 
 
 
596 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  29.36 
 
 
596 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  29.23 
 
 
552 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  29.4 
 
 
552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  28.55 
 
 
552 aa  191  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  29.23 
 
 
552 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  29.23 
 
 
552 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  29.23 
 
 
552 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  29.27 
 
 
553 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  28.72 
 
 
551 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  27.46 
 
 
551 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  27.46 
 
 
552 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  27.29 
 
 
552 aa  180  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  27.29 
 
 
551 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  27.12 
 
 
551 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  27.29 
 
 
551 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  27.65 
 
 
552 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  27.12 
 
 
551 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  27.12 
 
 
551 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  25.74 
 
 
565 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  27.78 
 
 
555 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
563 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  23.5 
 
 
569 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
569 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  23.77 
 
 
585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  24.1 
 
 
568 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  24.95 
 
 
559 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 
578 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  24.02 
 
 
637 aa  140  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
578 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.64 
 
 
579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.94 
 
 
579 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.36 
 
 
579 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.06 
 
 
579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.06 
 
 
579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  30.16 
 
 
345 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
571 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  28.06 
 
 
579 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  28.06 
 
 
579 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.46 
 
 
586 aa  124  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
495 aa  123  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 
578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  22.02 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 
578 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  21.09 
 
 
578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  21.26 
 
 
578 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  20.94 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  21.1 
 
 
578 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  21.1 
 
 
578 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  19.44 
 
 
589 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0937  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 
586 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
523 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  20.52 
 
 
555 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 
522 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1578  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
595 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.259952  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1897  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 
554 aa  68.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  22.19 
 
 
569 aa  67  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
526 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
517 aa  67  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.47 
 
 
502 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  21.88 
 
 
551 aa  65.1  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4335  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
526 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.83307  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  26.42 
 
 
526 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  22.33 
 
 
532 aa  64.7  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.57 
 
 
511 aa  63.5  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  25.12 
 
 
520 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
521 aa  63.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
517 aa  63.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  21.7 
 
 
554 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.31 
 
 
511 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  22.58 
 
 
523 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 
508 aa  60.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5439  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
593 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.22 
 
 
531 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
509 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>