More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1569 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  41.71 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  37.44 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 257 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  40.56 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  32.77 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  30.57 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.31 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  33.15 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.35 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 265 aa  89  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  29.27 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>