54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4141 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  67.33 
 
 
7434 aa  903    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  77.47 
 
 
781 aa  1087    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  62.09 
 
 
3864 aa  836    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  100 
 
 
819 aa  1632    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  75.64 
 
 
873 aa  1061    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  52.61 
 
 
889 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  66 
 
 
756 aa  907    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  53.09 
 
 
768 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  55.28 
 
 
770 aa  720    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  61.34 
 
 
1196 aa  846    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  61.69 
 
 
4830 aa  825    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  67.63 
 
 
768 aa  957    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  64.94 
 
 
860 aa  803    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  49.32 
 
 
764 aa  625  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  48.8 
 
 
790 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  49.01 
 
 
777 aa  584  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  48.48 
 
 
763 aa  555  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  60.14 
 
 
918 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  58.97 
 
 
465 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  53.44 
 
 
954 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  79.8 
 
 
479 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  40.55 
 
 
846 aa  300  9e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  48.55 
 
 
1641 aa  269  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  46.28 
 
 
3340 aa  268  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  41.44 
 
 
4428 aa  262  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  44.25 
 
 
2796 aa  243  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  78.77 
 
 
145 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.46 
 
 
3066 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.18 
 
 
2156 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  50.79 
 
 
1099 aa  168  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  32.14 
 
 
1526 aa  134  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  35.04 
 
 
5442 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  35.15 
 
 
4697 aa  131  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.17 
 
 
2768 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  31.41 
 
 
308 aa  91.3  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  28.7 
 
 
1699 aa  90.5  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.36 
 
 
2839 aa  84  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  32.49 
 
 
2886 aa  70.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  43.93 
 
 
2193 aa  68.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  35.24 
 
 
1359 aa  67  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  38.81 
 
 
1827 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.28 
 
 
4480 aa  60.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  30.25 
 
 
2194 aa  60.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  36.96 
 
 
1902 aa  58.9  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.91 
 
 
852 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  40.5 
 
 
1151 aa  55.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.17 
 
 
2927 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  28.97 
 
 
3146 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.55 
 
 
1627 aa  52.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  40.54 
 
 
1586 aa  48.9  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  27.21 
 
 
3227 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  29.14 
 
 
1321 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 
4678 aa  44.7  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  29.44 
 
 
2233 aa  44.3  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>