More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4002 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  667  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  58.18 
 
 
330 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  57.81 
 
 
325 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  57.99 
 
 
325 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0181  hypothetical protein  61.23 
 
 
341 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  51.4 
 
 
328 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  51.4 
 
 
328 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  51.52 
 
 
339 aa  310  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  50.83 
 
 
330 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.99 
 
 
328 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  49 
 
 
324 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.79 
 
 
331 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  47.24 
 
 
344 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  48.85 
 
 
328 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.45 
 
 
325 aa  285  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.45 
 
 
327 aa  285  1e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.02 
 
 
334 aa  283  4e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  45.4 
 
 
336 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.1 
 
 
327 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.79 
 
 
328 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  46.31 
 
 
322 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  45.2 
 
 
321 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  43.71 
 
 
332 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.21 
 
 
325 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.41 
 
 
336 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.21 
 
 
325 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.95 
 
 
339 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.39 
 
 
330 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.97 
 
 
330 aa  274  1e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.75 
 
 
335 aa  275  1e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.78 
 
 
339 aa  274  2e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.33 
 
 
327 aa  274  2e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  47.4 
 
 
339 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.27 
 
 
325 aa  273  4e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.77 
 
 
333 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.95 
 
 
325 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.41 
 
 
333 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.3 
 
 
328 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 
335 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  40.44 
 
 
328 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.05 
 
 
344 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.92 
 
 
331 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.62 
 
 
331 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.67 
 
 
330 aa  265  6e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.97 
 
 
338 aa  265  6e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.23 
 
 
345 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.23 
 
 
345 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  45.64 
 
 
323 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43.96 
 
 
321 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.49 
 
 
328 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  46.98 
 
 
324 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  46.5 
 
 
326 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.75 
 
 
328 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.21 
 
 
360 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  45.18 
 
 
310 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.78 
 
 
339 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.64 
 
 
328 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.57 
 
 
326 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.81 
 
 
329 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  45.03 
 
 
326 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.58 
 
 
358 aa  262  5e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.12 
 
 
314 aa  262  5e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  44.44 
 
 
327 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  44.65 
 
 
325 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  46.13 
 
 
335 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.99 
 
 
332 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  46.91 
 
 
330 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.01 
 
 
320 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.0806e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.58 
 
 
304 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.43 
 
 
337 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  42.19 
 
 
343 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  42.86 
 
 
337 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  49.67 
 
 
386 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.82 
 
 
323 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.08 
 
 
330 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.78 
 
 
325 aa  259  5e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  44.21 
 
 
351 aa  259  5e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  42.55 
 
 
334 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  46.1 
 
 
335 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.08 
 
 
334 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.85 
 
 
328 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  44.61 
 
 
339 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  45.09 
 
 
326 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.77 
 
 
335 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
327 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.27 
 
 
353 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.48 
 
 
324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  44.56 
 
 
325 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.1 
 
 
331 aa  257  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  42.06 
 
 
322 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.1 
 
 
331 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.9 
 
 
349 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  41.14 
 
 
346 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.14 
 
 
355 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.98 
 
 
332 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  43.09 
 
 
322 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.03 
 
 
324 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.29 
 
 
330 aa  255  9e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.29 
 
 
330 aa  255  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.56 
 
 
333 aa  254  1e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>