More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2767 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  100 
 
 
421 aa  867  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  63.34 
 
 
415 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  57.29 
 
 
403 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  50.75 
 
 
413 aa  399  1e-110  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  50.88 
 
 
413 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  51.03 
 
 
421 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  50.75 
 
 
411 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  49.62 
 
 
406 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  49.63 
 
 
413 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  48.62 
 
 
403 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  49.87 
 
 
406 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  49.75 
 
 
412 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  47.5 
 
 
407 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  47.25 
 
 
405 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  47.65 
 
 
400 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  48 
 
 
404 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  47.37 
 
 
403 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  50.13 
 
 
378 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  46.31 
 
 
407 aa  355  9e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  46.25 
 
 
433 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  45.78 
 
 
420 aa  353  3e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  46.12 
 
 
429 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  45.97 
 
 
410 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  45.39 
 
 
428 aa  343  3e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  46.75 
 
 
404 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  45.25 
 
 
404 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  44.24 
 
 
394 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  46.02 
 
 
404 aa  328  1e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.43842e-13  hitchhiker  1.39825e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  45.66 
 
 
391 aa  325  8e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  44.31 
 
 
412 aa  323  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  43.89 
 
 
419 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  45.39 
 
 
445 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  43.75 
 
 
462 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  43.78 
 
 
405 aa  305  1e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  42.76 
 
 
427 aa  304  2e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  43.92 
 
 
409 aa  304  2e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  42.26 
 
 
402 aa  303  5e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  42.41 
 
 
412 aa  300  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  42.64 
 
 
412 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  43.03 
 
 
404 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  42.68 
 
 
398 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.32 
 
 
402 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  41.83 
 
 
404 aa  286  3e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.08 
 
 
404 aa  287  3e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.08 
 
 
404 aa  287  3e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  38.1 
 
 
404 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  41.48 
 
 
404 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  37.84 
 
 
404 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  37.84 
 
 
404 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  42.36 
 
 
438 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  40.15 
 
 
394 aa  279  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  39.05 
 
 
417 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  38.1 
 
 
404 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  41.31 
 
 
417 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  42.36 
 
 
403 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  41.09 
 
 
404 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  37.5 
 
 
402 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  42.04 
 
 
404 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  37.98 
 
 
419 aa  276  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  38.5 
 
 
394 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  38.5 
 
 
394 aa  276  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  39.37 
 
 
396 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  38.79 
 
 
409 aa  275  1e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  37.59 
 
 
404 aa  274  2e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  40.58 
 
 
396 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  39.28 
 
 
395 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  8.24162e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  36.86 
 
 
404 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  42.71 
 
 
401 aa  270  3e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  37.34 
 
 
404 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.58 
 
 
394 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  39.55 
 
 
397 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.05 
 
 
394 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  41.77 
 
 
425 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  47.57 
 
 
303 aa  267  3e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  41.48 
 
 
427 aa  267  3e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.27 
 
 
420 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  40.8 
 
 
367 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  39.39 
 
 
396 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  38.77 
 
 
420 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  37.93 
 
 
410 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  39.79 
 
 
419 aa  262  7e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  36.67 
 
 
419 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  38.27 
 
 
421 aa  262  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  37.12 
 
 
397 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  39.01 
 
 
420 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  38.59 
 
 
387 aa  260  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  39.26 
 
 
407 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  36.9 
 
 
419 aa  259  5e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  37.37 
 
 
387 aa  259  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  39.76 
 
 
401 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  36.04 
 
 
424 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  38.44 
 
 
395 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  39.5 
 
 
402 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  38.21 
 
 
411 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.92707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.78 
 
 
421 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  36.05 
 
 
419 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  37.5 
 
 
402 aa  256  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  36.56 
 
 
396 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  36.87 
 
 
391 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  35.75 
 
 
389 aa  255  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>