More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2716 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 379 aa  783    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  44.84 
 
 		 249 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  42.02 
 
 		 260 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  42.6 
 
 		 241 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  40.71 
 
 		 241 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  32.74 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  43.85 
 
 		 548 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  43.85 
 
 		 545 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2483  AMP-dependent synthetase and ligase  43.85 
 
 		 548 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3590  AMP-dependent synthetase and ligase  55.88 
 
 		 547 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4096  acyl-CoA synthetase  50.45 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212968 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6424  AMP-dependent synthetase and ligase  51.55 
 
 		 551 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 		 550 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0896483  normal  0.0414381 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  31.84 
 
 		 235 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1570  acyl-CoA synthetase  49.51 
 
 		 549 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  31.84 
 
 		 234 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2005  acyl-CoA synthetase  52.58 
 
 		 547 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0857661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0511  AMP-dependent synthetase and ligase  47.42 
 
 		 551 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 253 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 245 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.34 
 
 		 233 aa  99.8  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  29.49 
 
 		 237 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2782  acyl-CoA synthetase  55.67 
 
 		 543 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.7 
 
 		 252 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 236 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6767  acyl-CoA synthetase  56.7 
 
 		 543 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196968  normal  0.258132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3119  acyl-CoA synthetase  47.37 
 
 		 549 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2720  acyl-CoA synthetase  48.65 
 
 		 549 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120351  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  30.91 
 
 		 237 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 252 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  28.57 
 
 		 258 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  34.56 
 
 		 223 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3533  acyl-CoA synthetase  52.83 
 
 		 546 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.8024  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 256 aa  93.2  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 253 aa  93.2  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2709  acyl-CoA synthetase  46.85 
 
 		 549 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 240 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1435  putative CoA ligase (AMP-forming)  44 
 
 		 552 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.760271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2684  acyl-CoA synthetase  45.95 
 
 		 549 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4308  acyl-CoA synthetase  49.43 
 
 		 544 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.458975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2369  acyl-CoA synthetase  46.81 
 
 		 540 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.67 
 
 		 230 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  32.29 
 
 		 245 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4259  AMP-binding protein  43.36 
 
 		 541 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2221  acyl-CoA synthetase  45.74 
 
 		 540 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  50.94 
 
 		 546 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  31.58 
 
 		 261 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3553  acyl-CoA synthetase  45.74 
 
 		 540 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1108  acyl-CoA synthetase  48.45 
 
 		 551 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4590  acyl-CoA synthetase  48.45 
 
 		 551 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.907923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0024  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 		 544 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0019  acyl-CoA synthetase  38.13 
 
 		 544 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.9 
 
 		 235 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  29.91 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  29.91 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  29.91 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2093  acyl-CoA synthetase  44.68 
 
 		 542 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  29.91 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4310  acyl-CoA synthetase  53.61 
 
 		 550 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.213622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2080  AMP-dependent synthetase and ligase  50.57 
 
 		 543 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4191  acyl-CoA synthetase  51.55 
 
 		 550 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4071  acyl-CoA synthetase  51.55 
 
 		 550 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3713  acyl-CoA synthetase  51.55 
 
 		 550 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3222  acyl-CoA synthetase  51.55 
 
 		 550 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831142  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4295  acyl-CoA synthetase  51.55 
 
 		 550 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 235 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 249 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5768  acyl-CoA synthetase  36.88 
 
 		 544 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28.12 
 
 		 228 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 250 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 247 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.38 
 
 		 241 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2076  AMP-dependent synthetase and ligase  46.67 
 
 		 556 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0086171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25250  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 540 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.68 
 
 		 228 aa  86.3  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  48.31 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.586965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0063  AMP-dependent synthetase and ligase  42.74 
 
 		 550 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0226  acyl-CoA synthetase  53.49 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1724  acyl-CoA synthetase  50.52 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0193  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 		 554 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  32.7 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0900  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0183173  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09660  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00865902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  28.77 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  44 
 
 		 544 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0180  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  39.36 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.115712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  27.93 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>