More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4191 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4295  acyl-CoA synthetase  95.45 
 
 		 550 aa  1036    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3553  acyl-CoA synthetase  58.99 
 
 		 540 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2483  AMP-dependent synthetase and ligase  67.76 
 
 		 548 aa  780    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.279875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1076  acyl-CoA synthetase  87.71 
 
 		 553 aa  960    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0511  AMP-dependent synthetase and ligase  61.27 
 
 		 551 aa  717    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2080  AMP-dependent synthetase and ligase  59.85 
 
 		 543 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0509  acyl-CoA synthetase  87.34 
 
 		 553 aa  958    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1474  acyl-CoA synthetase  87.34 
 
 		 553 aa  956    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1394  acyl-CoA synthetase  87.34 
 
 		 553 aa  958    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592914  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0180  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  55.93 
 
 		 554 aa  640    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.115712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0226  acyl-CoA synthetase  60.62 
 
 		 545 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6424  AMP-dependent synthetase and ligase  58.46 
 
 		 551 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1291  AMP-dependent synthetase and ligase  62.55 
 
 		 550 aa  733    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0896483  normal  0.0414381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2076  AMP-dependent synthetase and ligase  56.83 
 
 		 556 aa  654    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0086171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4308  acyl-CoA synthetase  72.84 
 
 		 544 aa  823    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.458975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1435  putative CoA ligase (AMP-forming)  58.32 
 
 		 552 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.760271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2093  acyl-CoA synthetase  60.26 
 
 		 542 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2306  acyl-CoA synthetase  87.34 
 
 		 553 aa  957    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6767  acyl-CoA synthetase  79.81 
 
 		 543 aa  880    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196968  normal  0.258132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25250  acyl-CoA synthetase  60.41 
 
 		 540 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0138  acyl-CoA synthetase  87.34 
 
 		 553 aa  956    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1724  acyl-CoA synthetase  93.99 
 
 		 556 aa  1021    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4096  acyl-CoA synthetase  60.55 
 
 		 547 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1658  acyl-CoA synthetase  59.52 
 
 		 542 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.125326  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1686  acyl-CoA synthetase  87.77 
 
 		 553 aa  963    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4191  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 550 aa  1127    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2684  acyl-CoA synthetase  59.96 
 
 		 549 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  60.49 
 
 		 542 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591871  normal  0.469505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0019  acyl-CoA synthetase  71.19 
 
 		 544 aa  807    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3590  AMP-dependent synthetase and ligase  62.55 
 
 		 547 aa  706    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2709  acyl-CoA synthetase  60.18 
 
 		 549 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3119  acyl-CoA synthetase  59.52 
 
 		 549 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186561  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0024  acyl-CoA synthetase  71.56 
 
 		 544 aa  810    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2782  acyl-CoA synthetase  79.11 
 
 		 543 aa  873    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  63.65 
 
 		 546 aa  693    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0900  acyl-CoA synthetase  58.8 
 
 		 540 aa  658    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0183173  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3222  acyl-CoA synthetase  95.45 
 
 		 550 aa  1036    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831142  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3533  acyl-CoA synthetase  63.03 
 
 		 546 aa  708    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.8024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2720  acyl-CoA synthetase  60.89 
 
 		 549 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120351  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2005  acyl-CoA synthetase  60.73 
 
 		 547 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0857661  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0193  AMP-dependent synthetase and ligase  56.67 
 
 		 554 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2369  acyl-CoA synthetase  60.11 
 
 		 540 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5039  AMP-dependent synthetase and ligase  68.37 
 
 		 548 aa  774    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2221  acyl-CoA synthetase  59.36 
 
 		 540 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3136  AMP-dependent synthetase and ligase  67.95 
 
 		 545 aa  776    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5768  acyl-CoA synthetase  72.11 
 
 		 544 aa  814    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0993  acyl-CoA synthetase  87.34 
 
 		 553 aa  957    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.936979  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4071  acyl-CoA synthetase  95.45 
 
 		 550 aa  1036    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4310  acyl-CoA synthetase  93.27 
 
 		 550 aa  996    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.213622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3817  acyl-CoA synthetase  60.79 
 
 		 539 aa  677    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.710335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1570  acyl-CoA synthetase  62.09 
 
 		 549 aa  687    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3713  acyl-CoA synthetase  98.73 
 
 		 550 aa  1117    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09660  acyl-CoA synthetase  58.99 
 
 		 540 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00865902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2111  AMP-dependent synthetase and ligase  55.47 
 
 		 560 aa  629  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2689  AMP-dependent synthetase and ligase  59.07 
 
 		 543 aa  627  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.586965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  57.22 
 
 		 544 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1170  acyl-CoA synthetase  56.16 
 
 		 543 aa  627  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0279011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  56.48 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.656252  hitchhiker  0.0000000000010579 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7038  hypothetical protein  56.88 
 
 		 544 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4259  AMP-binding protein  53.75 
 
 		 541 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4540  AMP-dependent synthetase and ligase  57.73 
 
 		 543 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2536  acyl-CoA synthetase  56.32 
 
 		 558 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  59.1 
 
 		 652 aa  608  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.497537  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4171  AMP-dependent synthetase and ligase  57.36 
 
 		 543 aa  608  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1502  AMP-dependent synthetase and ligase  57.83 
 
 		 545 aa  601  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3250  AMP-dependent synthetase and ligase  55.08 
 
 		 545 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0550813  normal  0.598947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4913  AMP-dependent synthetase and ligase  55.08 
 
 		 545 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6506  AMP-dependent synthetase and ligase  55.08 
 
 		 545 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00389964  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4590  acyl-CoA synthetase  56.03 
 
 		 551 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.907923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1108  acyl-CoA synthetase  56.03 
 
 		 551 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4911  AMP-dependent synthetase and ligase  54.6 
 
 		 550 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5939  AMP-dependent synthetase and ligase  53.66 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0683  AMP-dependent synthetase and ligase  54.24 
 
 		 550 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000214245  normal  0.363431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5782  AMP-dependent synthetase and ligase  52.1 
 
 		 550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6026  AMP-dependent synthetase and ligase  51.92 
 
 		 550 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0833  AMP-dependent synthetase and ligase  55.83 
 
 		 541 aa  568  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0919846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6221  AMP-dependent synthetase and ligase  52.58 
 
 		 550 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1565  AMP-dependent synthetase and ligase  54.21 
 
 		 543 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0063  AMP-dependent synthetase and ligase  54.87 
 
 		 550 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6109  AMP-dependent synthetase and ligase  52.84 
 
 		 558 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.649133  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  53.45 
 
 		 548 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2979  AMP-dependent synthetase and ligase  54.03 
 
 		 543 aa  538  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0673597  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  53.48 
 
 		 549 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2795  acyl-CoA synthetase  52.15 
 
 		 548 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35940  acyl-CoA synthetase  52.14 
 
 		 548 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629004  hitchhiker  4.55863e-16 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1599  AMP-binding protein  53.11 
 
 		 549 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.4226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2052  AMP-dependent synthetase and ligase  51.52 
 
 		 523 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0606  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 		 560 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0030  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 541 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2329  AMP-dependent synthetase and ligase  49.04 
 
 		 521 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.247287  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3751  hypothetical protein  51.96 
 
 		 549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0787  AMP-dependent synthetase and ligase  52.14 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  44.49 
 
 		 549 aa  448  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5356  AMP-dependent synthetase and ligase  45.66 
 
 		 523 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  41.38 
 
 		 530 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04201  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04270)  40.43 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.475143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  41.84 
 
 		 532 aa  363  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0820  AMP-dependent synthetase and ligase  41.24 
 
 		 538 aa  359  8e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 531 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 511 aa  332  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>