96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0052 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  37.46 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  37.59 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  37.24 
 
 
302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  37.24 
 
 
302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  36.9 
 
 
302 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  36.9 
 
 
302 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  36.9 
 
 
302 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  36.9 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  37.11 
 
 
304 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.99 
 
 
312 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  39.86 
 
 
302 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  39.86 
 
 
302 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  39.86 
 
 
302 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  39.86 
 
 
302 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  39.86 
 
 
302 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  39.52 
 
 
302 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  39.86 
 
 
302 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  38.1 
 
 
302 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.99 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.22 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  37.58 
 
 
297 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  36.74 
 
 
330 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  38.89 
 
 
314 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  38.13 
 
 
286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  37.94 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  40.91 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  38.52 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  37.62 
 
 
327 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  39.02 
 
 
295 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  39.02 
 
 
295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  42.59 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  39.77 
 
 
295 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  39.77 
 
 
295 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  39.77 
 
 
295 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  39.86 
 
 
332 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  37.86 
 
 
288 aa  158  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.55 
 
 
295 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 
287 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  41.45 
 
 
287 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.54 
 
 
320 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  38.28 
 
 
315 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  43.19 
 
 
295 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  39.41 
 
 
312 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  36.04 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  36.58 
 
 
290 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  39.02 
 
 
295 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  36.88 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  39.29 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  41.09 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  35.79 
 
 
313 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  34.51 
 
 
289 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  36.84 
 
 
289 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 
287 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  33.93 
 
 
287 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 
301 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  39.55 
 
 
295 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  34.88 
 
 
289 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 
287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  36.44 
 
 
288 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  36.25 
 
 
285 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 
306 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  38.46 
 
 
318 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  38.57 
 
 
287 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.8 
 
 
295 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  41.39 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.4 
 
 
298 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  35.93 
 
 
300 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  34.6 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  35.66 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.07 
 
 
299 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  35.6 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  33.62 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  35.93 
 
 
286 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.05 
 
 
284 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  34.75 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.2 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  21 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  24.21 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.56 
 
 
312 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  29.63 
 
 
305 aa  45.8  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  34.07 
 
 
298 aa  45.8  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.79 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  33.33 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  24.9 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  26.04 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.22 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  30.24 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  27.55 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  25.55 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>