More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3778 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  58.23 
 
 		 777 aa  769    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  52.62 
 
 		 780 aa  680    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 796 aa  1660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  55.88 
 
 		 687 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  40.9 
 
 		 734 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  40.9 
 
 		 734 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  41.08 
 
 		 731 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  41.73 
 
 		 757 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  40.9 
 
 		 734 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  45.83 
 
 		 731 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  40.9 
 
 		 734 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  40.9 
 
 		 734 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  40.94 
 
 		 734 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  46.43 
 
 		 734 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  46.6 
 
 		 734 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  42.2 
 
 		 778 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  41.81 
 
 		 755 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  38.65 
 
 		 769 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  41.77 
 
 		 794 aa  532  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  43.36 
 
 		 907 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  42.67 
 
 		 792 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  45.43 
 
 		 774 aa  528  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  40.87 
 
 		 756 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  44.94 
 
 		 748 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  45.38 
 
 		 730 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  44.62 
 
 		 788 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  39.27 
 
 		 741 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  46.49 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  45.47 
 
 		 645 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  49.11 
 
 		 841 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  49.31 
 
 		 841 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  49.31 
 
 		 841 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  39.31 
 
 		 741 aa  502  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  49.11 
 
 		 838 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  39.45 
 
 		 741 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  38.38 
 
 		 735 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  41.52 
 
 		 712 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  49.02 
 
 		 901 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  49.5 
 
 		 886 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  40.51 
 
 		 689 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  40.71 
 
 		 689 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  40.84 
 
 		 643 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  40.99 
 
 		 646 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  47.39 
 
 		 975 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  40.67 
 
 		 785 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  39.12 
 
 		 753 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  36.15 
 
 		 771 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  41.54 
 
 		 729 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  41.54 
 
 		 729 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  43.53 
 
 		 743 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  40.2 
 
 		 714 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  41.2 
 
 		 730 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  35.76 
 
 		 794 aa  432  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  34.96 
 
 		 724 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  40.53 
 
 		 775 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  40.53 
 
 		 775 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  40.53 
 
 		 775 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  40.35 
 
 		 775 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  40.35 
 
 		 775 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  40.35 
 
 		 775 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  40.35 
 
 		 775 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  38.15 
 
 		 676 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  40.89 
 
 		 683 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  38.79 
 
 		 725 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  38.46 
 
 		 916 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  38.46 
 
 		 874 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 		 922 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  40.89 
 
 		 683 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  40.22 
 
 		 1048 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  41.37 
 
 		 872 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  40.79 
 
 		 619 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  40.71 
 
 		 1057 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  40.1 
 
 		 858 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  40.1 
 
 		 896 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  40.1 
 
 		 930 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  40.78 
 
 		 1981 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  41.15 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  37.34 
 
 		 703 aa  366  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  34.07 
 
 		 767 aa  362  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  34.94 
 
 		 748 aa  361  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  33.93 
 
 		 767 aa  360  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  36.09 
 
 		 661 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.92 
 
 		 661 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 		 661 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 		 661 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 		 661 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 		 661 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 		 661 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  38 
 
 		 645 aa  357  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.24 
 
 		 661 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  37.06 
 
 		 618 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  31.94 
 
 		 792 aa  348  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  33.8 
 
 		 783 aa  346  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  36.48 
 
 		 668 aa  346  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  34.7 
 
 		 668 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  34.42 
 
 		 613 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  35.99 
 
 		 668 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  36.15 
 
 		 616 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 618 aa  335  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  40.66 
 
 		 611 aa  334  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>