199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0036 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0036    100 
 
 		 696 bp  1380    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  78.8 
 
 		 1632 bp  151  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  87.13 
 
 		 1296 bp  97.6  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  86.54 
 
 		 1290 bp  95.6  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  85.98 
 
 		 1098 bp  93.7  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1253  methyl-accepting chemotaxis protein  85.58 
 
 		 1290 bp  87.7  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1128  methyl-accepting chemotaxis protein  85.58 
 
 		 1290 bp  87.7  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1013    86.32 
 
 		 774 bp  85.7  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.197181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  80.42 
 
 		 1644 bp  81.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  84.76 
 
 		 1983 bp  81.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  88.31 
 
 		 1641 bp  81.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4372  methyl-accepting chemotaxis protein  88.16 
 
 		 1860 bp  79.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  85.26 
 
 		 2037 bp  77.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  85.26 
 
 		 1974 bp  77.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  88.73 
 
 		 1098 bp  77.8  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  85.26 
 
 		 1977 bp  77.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  88.73 
 
 		 1098 bp  77.8  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  85.26 
 
 		 1983 bp  77.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  84.69 
 
 		 1377 bp  75.8  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.84 
 
 		 2028 bp  75.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.39 
 
 		 1893 bp  73.8  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  83.19 
 
 		 1803 bp  73.8  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.67 
 
 		 1674 bp  73.8  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.418138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  88.24 
 
 		 2115 bp  71.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  88.24 
 
 		 1431 bp  71.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  95.45 
 
 		 1128 bp  71.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.84 
 
 		 1869 bp  71.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0796  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.07 
 
 		 1863 bp  71.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  85.71 
 
 		 1581 bp  71.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0142    84.21 
 
 		 1972 bp  69.9  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  84.21 
 
 		 1971 bp  69.9  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  87.14 
 
 		 1926 bp  67.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  93.48 
 
 		 1590 bp  67.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4057  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.49 
 
 		 1614 bp  67.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.67 
 
 		 1665 bp  67.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0372  methyl-accepting chemotaxis protein  86.49 
 
 		 1398 bp  67.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  85.37 
 
 		 1257 bp  67.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.49 
 
 		 2322 bp  67.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3929  methyl-accepting chemotaxis protein  85.19 
 
 		 1518 bp  65.9  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  85.71 
 
 		 1887 bp  65.9  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.86 
 
 		 1440 bp  65.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  91.84 
 
 		 1884 bp  65.9  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.3 
 
 		 1668 bp  65.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  83.7 
 
 		 1320 bp  63.9  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  82.41 
 
 		 1971 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0412    82.41 
 
 		 1953 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.7 
 
 		 1323 bp  63.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.803806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.5 
 
 		 1299 bp  63.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.320074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.7 
 
 		 1977 bp  63.9  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.41 
 
 		 1593 bp  63.9  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.29 
 
 		 1716 bp  63.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00224736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1822    85.53 
 
 		 915 bp  63.9  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  82.41 
 
 		 1950 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  82.41 
 
 		 1968 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  82.41 
 
 		 1965 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.7 
 
 		 1323 bp  63.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.29 
 
 		 2004 bp  63.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06258  hypothetical protein  86.76 
 
 		 1563 bp  63.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01898    84.81 
 
 		 729 bp  61.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  88.14 
 
 		 1584 bp  61.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  84.34 
 
 		 2025 bp  61.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  83.91 
 
 		 2103 bp  61.9  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  81.51 
 
 		 1644 bp  61.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1491    85.92 
 
 		 870 bp  61.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  90.2 
 
 		 1608 bp  61.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.57 
 
 		 1494 bp  61.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.33 
 
 		 1947 bp  61.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  83.91 
 
 		 2103 bp  61.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  83.91 
 
 		 2103 bp  61.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 		 1665 bp  61.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  83.16 
 
 		 2085 bp  61.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2678  methyl-accepting chemotaxis protein  83.91 
 
 		 1602 bp  61.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.83 
 
 		 1647 bp  61.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  84.34 
 
 		 1617 bp  61.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.49 
 
 		 1863 bp  61.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1621  methyl-accepting chemotaxis protein  97.06 
 
 		 1542 bp  60  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  85.14 
 
 		 1584 bp  60  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 2049 bp  60  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  83.72 
 
 		 1677 bp  60  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  91.3 
 
 		 1677 bp  60  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.14 
 
 		 1644 bp  60  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.15 
 
 		 1896 bp  60  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.3 
 
 		 1650 bp  60  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0861    82.08 
 
 		 1980 bp  60  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  84.62 
 
 		 1974 bp  60  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  82.08 
 
 		 2196 bp  60  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  84.62 
 
 		 1959 bp  60  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  84.62 
 
 		 1638 bp  60  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  97.06 
 
 		 1617 bp  60  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2601    85.71 
 
 		 1625 bp  60  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774495  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  81.9 
 
 		 1623 bp  58  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  81.9 
 
 		 1989 bp  58  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  81.9 
 
 		 1980 bp  58  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  81.9 
 
 		 1956 bp  58  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04747  methyl-accepting chemotaxis protein  81.2 
 
 		 1086 bp  58  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.68 
 
 		 3999 bp  58  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514754  normal  0.661078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.15 
 
 		 2037 bp  58  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.68 
 
 		 1590 bp  58  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.68 
 
 		 1455 bp  58  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  86.15 
 
 		 1881 bp  58  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>