170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1013 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1013    100 
 
 		 774 bp  1534    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.197181  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  95.15 
 
 		 1098 bp  165  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  91.26 
 
 		 2196 bp  133  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.01 
 
 		 1977 bp  101  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.01 
 
 		 1959 bp  101  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  85.71 
 
 		 1803 bp  101  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  86.24 
 
 		 1098 bp  97.6  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  90 
 
 		 1701 bp  95.6  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  86.11 
 
 		 1965 bp  95.6  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.91 
 
 		 2163 bp  93.7  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.91 
 
 		 2163 bp  93.7  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0861    86.41 
 
 		 1980 bp  93.7  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  87.37 
 
 		 1257 bp  93.7  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  85.32 
 
 		 1098 bp  89.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.64 
 
 		 2049 bp  89.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.96 
 
 		 1266 bp  87.7  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.75 
 
 		 1647 bp  87.7  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.05 
 
 		 1992 bp  85.7  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0036    86.32 
 
 		 696 bp  85.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  89.19 
 
 		 1617 bp  83.8  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1867    86.17 
 
 		 1713 bp  83.8  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.52 
 
 		 1908 bp  81.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  86.52 
 
 		 1128 bp  81.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1491  chemotaxis sensory transducer  90.77 
 
 		 1182 bp  81.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000901619  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1491    84.4 
 
 		 870 bp  81.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  84.26 
 
 		 1992 bp  79.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0412    84.26 
 
 		 1953 bp  79.8  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  84.26 
 
 		 1950 bp  79.8  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  84.26 
 
 		 1971 bp  79.8  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  86.21 
 
 		 1662 bp  77.8  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  84.47 
 
 		 1965 bp  77.8  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  86.05 
 
 		 2103 bp  75.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  86.05 
 
 		 2103 bp  75.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  90.32 
 
 		 1404 bp  75.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  86.05 
 
 		 2103 bp  75.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  85.39 
 
 		 2037 bp  73.8  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  83.33 
 
 		 1380 bp  71.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  84.62 
 
 		 1983 bp  69.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  84.62 
 
 		 1983 bp  69.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  84.62 
 
 		 1983 bp  69.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.67 
 
 		 993 bp  69.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  89.83 
 
 		 1884 bp  69.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  85.06 
 
 		 1974 bp  69.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  85.06 
 
 		 1959 bp  69.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  85.06 
 
 		 1638 bp  69.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  84.21 
 
 		 1971 bp  69.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  87.14 
 
 		 1641 bp  67.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4057  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.88 
 
 		 1614 bp  67.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.3 
 
 		 1668 bp  65.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  83.51 
 
 		 1380 bp  65.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1623 bp  65.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  83.51 
 
 		 1380 bp  65.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  85 
 
 		 1986 bp  63.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  86.76 
 
 		 2037 bp  63.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  83 
 
 		 1086 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83 
 
 		 1323 bp  63.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83 
 
 		 1323 bp  63.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.803806  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0159    83 
 
 		 1098 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  83 
 
 		 1995 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  83 
 
 		 1962 bp  63.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  83.52 
 
 		 1143 bp  61.9  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  83.52 
 
 		 1983 bp  61.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  83.52 
 
 		 1983 bp  61.9  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  83.52 
 
 		 1983 bp  61.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.81 
 
 		 1452 bp  61.9  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  83.52 
 
 		 1983 bp  61.9  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.52 
 
 		 1323 bp  61.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 		 2322 bp  61.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  83.52 
 
 		 2142 bp  61.9  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  83.52 
 
 		 1983 bp  61.9  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  82.52 
 
 		 1968 bp  61.9  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1294  methyl-accepting chemotaxis protein  85.92 
 
 		 1992 bp  61.9  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.14 
 
 		 1494 bp  60  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  85.71 
 
 		 2121 bp  60  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1822    83.72 
 
 		 915 bp  60  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1781  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  85.71 
 
 		 1998 bp  60  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0252457  hitchhiker  0.0000048768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  84.15 
 
 		 2001 bp  60  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  84.42 
 
 		 1452 bp  58  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  84.93 
 
 		 1584 bp  58  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1253  methyl-accepting chemotaxis protein  82.47 
 
 		 1290 bp  58  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.15 
 
 		 1899 bp  58  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.15 
 
 		 2856 bp  58  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0920  nitrate and nitrite sensing methyl-accepting chemotaxis protein  92.68 
 
 		 1989 bp  58  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1128  methyl-accepting chemotaxis protein  82.47 
 
 		 1290 bp  58  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0443    84.93 
 
 		 1856 bp  58  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.733414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.42 
 
 		 1569 bp  58  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  83.15 
 
 		 2001 bp  58  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  83.15 
 
 		 1581 bp  58  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  83.15 
 
 		 1602 bp  58  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  82.47 
 
 		 1290 bp  58  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  82.61 
 
 		 1782 bp  56  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  82.61 
 
 		 1755 bp  56  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 1953 bp  56  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.72 
 
 		 1299 bp  56  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.320074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.95 
 
 		 1869 bp  56  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00784755  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  85.29 
 
 		 1986 bp  56  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  82 
 
 		 1968 bp  56  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  81.48 
 
 		 1296 bp  56  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1937  methyl-accepting chemotaxis protein  84 
 
 		 1989 bp  54  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  82.76 
 
 		 1962 bp  54  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>