182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1822 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1822    100 
 
 		 915 bp  1814    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2601    90.14 
 
 		 1625 bp  85.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774495  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.21 
 
 		 2163 bp  83.8  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.21 
 
 		 2163 bp  83.8  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  86.59 
 
 		 2115 bp  75.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0920  nitrate and nitrite sensing methyl-accepting chemotaxis protein  85.56 
 
 		 1989 bp  75.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1253  methyl-accepting chemotaxis protein  86.59 
 
 		 1290 bp  75.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  86.59 
 
 		 1611 bp  75.8  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1128  methyl-accepting chemotaxis protein  86.59 
 
 		 1290 bp  75.8  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  84.31 
 
 		 1620 bp  75.8  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001468  methyl-accepting chemotaxis protein  88.41 
 
 		 2001 bp  73.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  87.01 
 
 		 1962 bp  73.8  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.01 
 
 		 1452 bp  73.8  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  85.88 
 
 		 1968 bp  73.8  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  91.07 
 
 		 1626 bp  71.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1863 bp  71.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.06 
 
 		 1992 bp  71.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05406  histidine kinase/response regulator hybrid protein  88.24 
 
 		 2001 bp  71.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  84.21 
 
 		 2001 bp  69.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.06 
 
 		 1323 bp  69.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.88 
 
 		 1266 bp  67.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  85.37 
 
 		 1662 bp  67.9  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.49 
 
 		 1575 bp  67.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  85.37 
 
 		 1965 bp  67.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  86.49 
 
 		 1575 bp  67.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  88.71 
 
 		 1884 bp  67.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.49 
 
 		 1575 bp  67.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0612  methyl-accepting chemotaxis protein  85.37 
 
 		 1290 bp  67.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  85.9 
 
 		 1968 bp  67.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01599  hypothetical protein  88.71 
 
 		 1452 bp  67.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003516  methyl-accepting chemotaxis protein  83.51 
 
 		 2019 bp  65.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0337071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  85.71 
 
 		 2001 bp  65.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  85.71 
 
 		 1803 bp  65.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0361  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.69 
 
 		 1806 bp  65.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  89.47 
 
 		 1446 bp  65.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.27 
 
 		 1665 bp  65.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  86.3 
 
 		 1641 bp  65.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000502  methyl-accepting chemotaxis protein  85.19 
 
 		 1770 bp  65.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.567249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0065  methyl-accepting chemotaxis protein  83.87 
 
 		 1695 bp  65.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00962116  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0036    85.53 
 
 		 696 bp  63.9  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  84.09 
 
 		 1626 bp  63.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03783  Methyl-accepting chemotaxis protein (PAS/PAC and MSP doamins)  84.09 
 
 		 1584 bp  63.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.76 
 
 		 1644 bp  63.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.76 
 
 		 1596 bp  63.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1016  methyl-accepting chemotaxis protein  85.53 
 
 		 1692 bp  63.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  88.33 
 
 		 1953 bp  63.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.52 
 
 		 1623 bp  63.9  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0861    85 
 
 		 1980 bp  63.9  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  85.92 
 
 		 1098 bp  61.9  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.09 
 
 		 1593 bp  61.9  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  85.92 
 
 		 1098 bp  61.9  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  85.92 
 
 		 1887 bp  61.9  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.34 
 
 		 1305 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00866  hypothetical protein  94.87 
 
 		 1257 bp  61.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  92.86 
 
 		 2088 bp  60  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  84.15 
 
 		 1983 bp  60  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  84.15 
 
 		 1983 bp  60  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  84.15 
 
 		 1983 bp  60  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  84.15 
 
 		 1983 bp  60  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  91.3 
 
 		 2025 bp  60  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  84.15 
 
 		 1983 bp  60  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5185  methyl-accepting chemotaxis protein  83.72 
 
 		 1695 bp  60  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00149704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  84.15 
 
 		 1983 bp  60  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.14 
 
 		 1977 bp  60  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0282    85.71 
 
 		 1626 bp  60  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  85.14 
 
 		 1635 bp  60  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  85.14 
 
 		 1974 bp  60  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  83.72 
 
 		 1098 bp  60  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1013    83.72 
 
 		 774 bp  60  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.197181  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  85.14 
 
 		 1959 bp  60  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  85.14 
 
 		 1791 bp  60  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  85.14 
 
 		 1638 bp  60  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1305 bp  60  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.72 
 
 		 1629 bp  60  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  84.15 
 
 		 1971 bp  60  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3300  methyl-accepting chemotaxis protein  82.47 
 
 		 1608 bp  58  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1444    88.68 
 
 		 3459 bp  58  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  82.47 
 
 		 1884 bp  58  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0142    92.68 
 
 		 1972 bp  58  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  87.72 
 
 		 1185 bp  58  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  84.93 
 
 		 1551 bp  58  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  87.5 
 
 		 2025 bp  56  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  92.5 
 
 		 1884 bp  56  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0356  chemotaxis sensory transducer  83.75 
 
 		 1959 bp  56  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  84.21 
 
 		 1431 bp  56  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 1998 bp  56  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.75 
 
 		 1872 bp  56  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 1626 bp  56  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00762848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 1509 bp  56  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  83.33 
 
 		 1695 bp  56  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  86.67 
 
 		 1983 bp  56  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1204  MCP-domain signal transduction protein  84.21 
 
 		 1296 bp  56  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.302368  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.5 
 
 		 1635 bp  56  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.88 
 
 		 1572 bp  56  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0287623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  82.61 
 
 		 1089 bp  56  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  82.95 
 
 		 1380 bp  56  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  83.33 
 
 		 1983 bp  56  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  87.5 
 
 		 1887 bp  56  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06258  hypothetical protein  85.29 
 
 		 1563 bp  56  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  83.33 
 
 		 1983 bp  56  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>