83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0443 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0443    100 
 
 		 1856 bp  3679    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.733414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  87.64 
 
 		 1641 bp  89.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  85.86 
 
 		 1677 bp  85.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4057  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85 
 
 		 1614 bp  79.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  82.03 
 
 		 1620 bp  71.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.21 
 
 		 1863 bp  69.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.67 
 
 		 2004 bp  67.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  97.3 
 
 		 1983 bp  65.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  84.27 
 
 		 1638 bp  65.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02986  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1134 bp  65.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  91.67 
 
 		 1551 bp  63.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  90.38 
 
 		 1983 bp  63.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3553  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.3 
 
 		 2004 bp  61.9  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.83 
 
 		 2007 bp  61.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3380    91.49 
 
 		 390 bp  61.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1012  hypothetical protein  90 
 
 		 1881 bp  60  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0372  methyl-accepting chemotaxis protein  85.14 
 
 		 1398 bp  60  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  94.74 
 
 		 1644 bp  60  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1491  chemotaxis sensory transducer  84.15 
 
 		 1182 bp  60  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000901619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  86.15 
 
 		 1695 bp  58  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.93 
 
 		 1869 bp  58  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00784755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2678  methyl-accepting chemotaxis protein  82.47 
 
 		 1602 bp  58  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221197  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1013    84.93 
 
 		 774 bp  58  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.197181  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  84.93 
 
 		 1098 bp  58  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.18 
 
 		 1650 bp  58  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  94.59 
 
 		 1983 bp  58  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  94.44 
 
 		 1953 bp  56  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.75 
 
 		 1863 bp  56  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.61 
 
 		 1446 bp  56  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.75 
 
 		 1863 bp  56  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.912748  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.73 
 
 		 1992 bp  56  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.47 
 
 		 1869 bp  56  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.55 
 
 		 1665 bp  54  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  90.7 
 
 		 1953 bp  54  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  90.7 
 
 		 1953 bp  54  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.11 
 
 		 2034 bp  54  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.76 
 
 		 2298 bp  54  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  90.7 
 
 		 1983 bp  54  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.82 
 
 		 1602 bp  54  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.29 
 
 		 1455 bp  52  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  83.78 
 
 		 2163 bp  52  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.67 
 
 		 2001 bp  52  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 1872 bp  52  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0528    88 
 
 		 1361 bp  52  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4209  chemotaxis sensory transducer  90.48 
 
 		 1305 bp  52  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.91 
 
 		 1869 bp  52  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  84.29 
 
 		 1902 bp  52  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1459  methyl-accepting chemotaxis protein  82.56 
 
 		 1881 bp  52  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  84.29 
 
 		 1257 bp  52  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2871  methyl-accepting chemotaxis protein  81.37 
 
 		 1626 bp  52  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  82.22 
 
 		 1584 bp  52  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.79 
 
 		 1632 bp  50.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.56 
 
 		 1647 bp  50.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4531  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  84.62 
 
 		 1305 bp  50.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0493  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.55 
 
 		 2181 bp  50.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.89 
 
 		 1707 bp  50.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  82.02 
 
 		 2001 bp  50.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3396    82.02 
 
 		 1446 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3052  methyl-accepting chemotaxis protein  84.06 
 
 		 1740 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.02 
 
 		 1998 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000150661  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.19 
 
 		 1266 bp  50.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.95 
 
 		 1299 bp  50.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.320074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  80.77 
 
 		 1626 bp  48.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  85.71 
 
 		 1665 bp  48.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  91.67 
 
 		 2121 bp  48.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  93.75 
 
 		 1641 bp  48.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001528  putative chemotaxis transducer  84.38 
 
 		 1314 bp  48.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4927  methyl-accepting chemotaxis protein/sensory box protein  84.38 
 
 		 1536 bp  48.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  88.64 
 
 		 1923 bp  48.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1665 bp  48.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.54 
 
 		 1248 bp  48.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.64 
 
 		 2289 bp  48.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 1497 bp  48.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.25 
 
 		 1863 bp  48.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  85.71 
 
 		 1665 bp  48.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.89 
 
 		 1221 bp  48.1  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00866  hypothetical protein  86.54 
 
 		 1257 bp  48.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.75 
 
 		 1959 bp  48.1  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3300  methyl-accepting chemotaxis protein  85.71 
 
 		 1608 bp  48.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.102754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.5 
 
 		 1863 bp  48.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.733563  normal  0.773778 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0331  methyl-accepting chemotaxis protein  83.33 
 
 		 1737 bp  48.1  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0155  methyl-accepting chemotaxis protein  87.5 
 
 		 1155 bp  48.1  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0336  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.82 
 
 		 1503 bp  48.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>