115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1867 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1867    100 
 
 
1713 bp  3396    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  90.62 
 
 
1965 bp  159  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  84.83 
 
 
1701 bp  139  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  88.18 
 
 
1971 bp  115  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  85.84 
 
 
1815 bp  97.6  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  84.87 
 
 
1083 bp  93.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1234  methyl-accepting chemotaxis protein  84.68 
 
 
1257 bp  85.7  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  89.19 
 
 
1584 bp  83.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1013    86.17 
 
 
774 bp  83.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.197181  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  90.77 
 
 
1452 bp  81.8  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  84.69 
 
 
1380 bp  75.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  90.32 
 
 
1323 bp  75.8  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  89.23 
 
 
2127 bp  73.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0638  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  85.88 
 
 
801 bp  73.8  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.21 
 
 
1692 bp  73.8  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.24 
 
 
1266 bp  71.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  82.35 
 
 
1086 bp  69.9  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.84 
 
 
1494 bp  69.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  84.21 
 
 
2094 bp  69.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.67 
 
 
1329 bp  67.9  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  83.02 
 
 
2142 bp  67.9  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.67 
 
 
2004 bp  67.9  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1202  chemotaxis sensory transducer  92 
 
 
1143 bp  67.9  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 
1959 bp  65.9  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 
1797 bp  65.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  87.69 
 
 
1902 bp  65.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0637    84.27 
 
 
546 bp  65.9  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.27 
 
 
1644 bp  65.9  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  86.3 
 
 
2037 bp  65.9  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.29 
 
 
2022 bp  63.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  89.29 
 
 
1968 bp  63.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 
2049 bp  61.9  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  86.57 
 
 
2022 bp  61.9  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1017  methyl-accepting chemotaxis protein  83.16 
 
 
1317 bp  61.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.16 
 
 
1314 bp  61.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0412    85.92 
 
 
1953 bp  61.9  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.778368  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  85.92 
 
 
1950 bp  61.9  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  85.92 
 
 
1971 bp  61.9  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  83.72 
 
 
1638 bp  60  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1860  chemotaxis sensory transducer  85.14 
 
 
1602 bp  60  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00521087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.14 
 
 
1575 bp  60  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  85.14 
 
 
1968 bp  60  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.65 
 
 
2064 bp  60  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.14 
 
 
1575 bp  60  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  85.14 
 
 
1575 bp  60  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  83.95 
 
 
1986 bp  58  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2733  methyl-accepting chemotaxis protein  88.68 
 
 
1458 bp  58  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.501844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  83.15 
 
 
2025 bp  58  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  84.93 
 
 
1380 bp  58  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  84.42 
 
 
1953 bp  58  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.18 
 
 
3240 bp  58  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  84.93 
 
 
1380 bp  58  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.15 
 
 
1626 bp  58  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000434326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.15 
 
 
1986 bp  58  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2309  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  86.15 
 
 
1644 bp  58  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.037772  hitchhiker  0.0000415162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.15 
 
 
1626 bp  58  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100073  normal  0.0339889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.5 
 
 
2445 bp  56  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.29 
 
 
1578 bp  56  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.29 
 
 
1569 bp  56  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  84.72 
 
 
1662 bp  56  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.75 
 
 
2022 bp  56  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 
1977 bp  54  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  94.29 
 
 
1536 bp  54  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.51 
 
 
1623 bp  54  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.13 
 
 
2028 bp  54  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1822    89.36 
 
 
915 bp  54  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  86.44 
 
 
2001 bp  54  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.11 
 
 
1953 bp  54  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.571634  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  82.56 
 
 
1623 bp  52  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  82.56 
 
 
1989 bp  52  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  82.56 
 
 
1980 bp  52  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  82.56 
 
 
1956 bp  52  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 
2163 bp  52  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 
2163 bp  52  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.29 
 
 
1665 bp  52  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  83.78 
 
 
1098 bp  52  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  88 
 
 
1641 bp  52  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  88 
 
 
1878 bp  52  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  82.56 
 
 
1980 bp  52  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  82.56 
 
 
1998 bp  52  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  82.56 
 
 
711 bp  52  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.29 
 
 
1575 bp  52  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3380    85.48 
 
 
390 bp  52  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  83.78 
 
 
1500 bp  52  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  83.78 
 
 
1128 bp  52  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  84.62 
 
 
1635 bp  50.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  85.96 
 
 
1482 bp  50.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1442  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.25 
 
 
1455 bp  50.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.25 
 
 
1446 bp  50.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  81.19 
 
 
2196 bp  50.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  84.62 
 
 
2001 bp  50.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.62 
 
 
1626 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  86.79 
 
 
1944 bp  50.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.79 
 
 
1668 bp  50.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.19 
 
 
1182 bp  50.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000818802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  86.79 
 
 
1602 bp  50.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  85.71 
 
 
1584 bp  48.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.52 
 
 
1992 bp  48.1  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 
3090 bp  48.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3010  chemotaxis sensory transducer  83.82 
 
 
1620 bp  48.1  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>