More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04970 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  725  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  60.86 
 
 
339 aa  439  1e-122  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 
295 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  28.87 
 
 
303 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  29.18 
 
 
304 aa  121  1e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 
309 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  30.6 
 
 
324 aa  117  4e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 
315 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 
308 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  29.32 
 
 
317 aa  111  2e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  27.91 
 
 
302 aa  110  4e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  29.48 
 
 
313 aa  110  4e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  27.6 
 
 
300 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  29.1 
 
 
322 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  29.23 
 
 
296 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  28.25 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  28.41 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  25.78 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  26.15 
 
 
289 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  26.03 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  26.22 
 
 
289 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  26.22 
 
 
289 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  26.22 
 
 
289 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  26.22 
 
 
289 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  25.48 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  26.57 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  25.58 
 
 
286 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 
290 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.67 
 
 
290 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  24.09 
 
 
294 aa  84.7  2e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  26.57 
 
 
289 aa  85.1  2e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  45.05 
 
 
241 aa  83.6  5e-15  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  24.09 
 
 
294 aa  82.4  9e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  40.74 
 
 
481 aa  82  2e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  22.83 
 
 
293 aa  80.5  4e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  27.34 
 
 
291 aa  80.1  5e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 
231 aa  78.6  2e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 
498 aa  78.2  2e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  24.74 
 
 
289 aa  77.8  2e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  22.86 
 
 
293 aa  76.6  6e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  25.87 
 
 
289 aa  76.3  8e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  23.32 
 
 
290 aa  75.9  9e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
449 aa  74.7  2e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  40.54 
 
 
241 aa  73.9  3e-12  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  25.81 
 
 
294 aa  74.3  3e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 
241 aa  73.9  3e-12  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 
440 aa  73.9  4e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  42 
 
 
167 aa  73.9  4e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 
374 aa  73.2  6e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
224 aa  72.8  9e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  23.35 
 
 
289 aa  72.4  1e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.87 
 
 
292 aa  72  1e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  36.36 
 
 
890 aa  72.4  1e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
193 aa  72.4  1e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  34.91 
 
 
398 aa  72.4  1e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  30.1 
 
 
523 aa  72  1e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 
445 aa  72  2e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  27.46 
 
 
319 aa  71.6  2e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 
416 aa  71.2  2e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
224 aa  71.6  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 
270 aa  70.9  3e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  49.32 
 
 
225 aa  70.5  4e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  47.14 
 
 
486 aa  70.9  4e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  26.42 
 
 
319 aa  70.1  5e-11  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  4.79334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  22.97 
 
 
287 aa  70.1  5e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
169 aa  70.1  5e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  42.68 
 
 
264 aa  70.1  5e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
239 aa  70.1  6e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.78 
 
 
656 aa  70.1  6e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 
525 aa  70.1  6e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  26.94 
 
 
319 aa  70.1  6e-11  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.11 
 
 
670 aa  69.7  6e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
220 aa  69.7  7e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 
236 aa  69.7  7e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  35.87 
 
 
505 aa  69.3  8e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 
270 aa  69.3  8e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 
270 aa  69.3  8e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  33.96 
 
 
631 aa  69.7  8e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
220 aa  69.3  9e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
220 aa  69.3  9e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
220 aa  69.3  9e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.79 
 
 
294 aa  69.3  9e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
220 aa  69.3  9e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
220 aa  69.3  9e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  48.61 
 
 
331 aa  68.9  1e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  31.9 
 
 
260 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
261 aa  69.3  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
220 aa  69.3  1e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  31.9 
 
 
260 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
543 aa  68.6  1e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
239 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  35.88 
 
 
219 aa  68.9  1e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>